51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2750 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2750  putative signal peptide protein  100 
 
 		 309 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2399  putative signal peptide protein  50.32 
 
 		 346 aa  255  6e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3233  hypothetical protein  44.26 
 
 		 315 aa  229  5e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.294837  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1209  hypothetical protein  45.71 
 
 		 322 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3423  hypothetical protein  44.92 
 
 		 318 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3701  hypothetical protein  44.9 
 
 		 318 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2757  hypothetical protein  43.69 
 
 		 318 aa  211  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3257  hypothetical protein  43.28 
 
 		 316 aa  209  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3182  hypothetical protein  43.17 
 
 		 326 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1013  hypothetical protein  41.67 
 
 		 362 aa  195  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5405  hypothetical protein  42.44 
 
 		 332 aa  189  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.562328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1447  hypothetical protein  33.54 
 
 		 364 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.944051 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2025  hypothetical protein  34.37 
 
 		 358 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.604471 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2152  hypothetical protein  34.37 
 
 		 358 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0374202  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1155  hypothetical protein  33.75 
 
 		 358 aa  150  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0968736  normal  0.0377322 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5421  hypothetical protein  32.82 
 
 		 358 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2133  hypothetical protein  32.82 
 
 		 358 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.089753 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5962  hypothetical protein  32.51 
 
 		 358 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2115  hypothetical protein  32.51 
 
 		 358 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0320662  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1697  hypothetical protein  32.12 
 
 		 407 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2204  hypothetical protein  31.39 
 
 		 358 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3114  hypothetical protein  31.39 
 
 		 358 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2587  hypothetical protein  31.39 
 
 		 358 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2641  hypothetical protein  31.39 
 
 		 358 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.192728  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1477  hypothetical protein  31.39 
 
 		 358 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2719  hypothetical protein  32.12 
 
 		 541 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1116  putative signal peptide protein  33.52 
 
 		 359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0385568  normal  0.357874 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1886  hypothetical protein  31.13 
 
 		 380 aa  134  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283934  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2568  hypothetical protein  36.1 
 
 		 388 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133782  normal  0.0201135 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1565  hypothetical protein  31.86 
 
 		 372 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491571  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1039  hypothetical protein  31.03 
 
 		 372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.306566 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1055  putative signal peptide protein  32.95 
 
 		 359 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23362  normal  0.366612 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0959  conserved hypothetical signal peptide protein  31.81 
 
 		 359 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.279719  normal  0.0122892 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1075  hypothetical protein  30.36 
 
 		 366 aa  106  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0562211  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1970  hypothetical protein  31.15 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00552765  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1250  hypothetical protein  28.7 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00240974  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2066  hypothetical protein  35.11 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1469  hypothetical protein  33.33 
 
 		 326 aa  72  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0488  hypothetical protein  28.27 
 
 		 326 aa  72.4  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.878212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1763  hypothetical protein  33.03 
 
 		 334 aa  67  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.724575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2837  hypothetical protein  27.81 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.601458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2416  hypothetical protein  29.69 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.845758  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1459  hypothetical protein  33.08 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1188  signal peptide protein  27.55 
 
 		 351 aa  62.4  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1820  putative signal peptide protein  30.14 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0395  regulatory protein  36.94 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0454  regulatory protein  36.94 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1814  regulatory protein  32.43 
 
 		 305 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0110601  normal  0.0340193 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00084  RpfE regulatory protein  31.53 
 
 		 306 aa  53.5  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.620416  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0475  hypothetical protein  37.33 
 
 		 321 aa  43.9  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0635  hypothetical protein  37.33 
 
 		 321 aa  43.9  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>