More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2706 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2706  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  634    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0706  protein serine/threonine phosphatase  78.69 
 
 
304 aa  501  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.546937 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1338  protein serine/threonine phosphatases  62.83 
 
 
300 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0859  protein serine/threonine phosphatase  61.18 
 
 
300 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0924  protein phosphatase 2C domain-containing protein  61.18 
 
 
300 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141764 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3580  protein serine/threonine phosphatase  59.61 
 
 
304 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568966  normal  0.133337 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0814  protein phosphatase 2C domain-containing protein  58.03 
 
 
299 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.556106  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4157  protein phosphatase 2C domain-containing protein  59.67 
 
 
299 aa  363  3e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4326  protein serine/threonine phosphatase  57.65 
 
 
304 aa  358  5e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2031  protein serine/threonine phosphatase  57.24 
 
 
301 aa  355  3.9999999999999996e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1628  protein serine/threonine phosphatases  56.07 
 
 
305 aa  350  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0588752  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0853  protein serine/threonine phosphatases  48.84 
 
 
304 aa  292  5e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0260925  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2476  protein phosphatase 2C-like  48.84 
 
 
304 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209161  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2158  hypothetical protein  44.88 
 
 
304 aa  279  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545474  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2279  protein serine/threonine phosphatase  45.54 
 
 
304 aa  278  9e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1959  protein serine/threonine phosphatase  45.21 
 
 
304 aa  276  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0968187  normal  0.460535 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3850  protein phosphatase 2C-like  44.95 
 
 
306 aa  272  5.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.632608  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4023  protein serine/threonine phosphatase  44.88 
 
 
307 aa  256  4e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0476  protein serine/threonine phosphatase  40.71 
 
 
302 aa  235  9e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0044  protein serine/threonine phosphatases  39.14 
 
 
306 aa  217  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2317  protein serine/threonine phosphatases  36.07 
 
 
253 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  34.5 
 
 
236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.96 
 
 
237 aa  112  9e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3311  protein phosphatase 2C-like  30.49 
 
 
265 aa  109  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0175137 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  33.62 
 
 
538 aa  109  6e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1640  protein serine/threonine phosphatase  32.37 
 
 
259 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  35.68 
 
 
257 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  35.08 
 
 
394 aa  105  9e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  34.5 
 
 
241 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0073  protein serine/threonine phosphatase  32.53 
 
 
276 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.736868 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  35.83 
 
 
320 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2619  protein serine/threonine phosphatases  33.2 
 
 
253 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0996271  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  32 
 
 
238 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  35.25 
 
 
305 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  38.33 
 
 
467 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  36.48 
 
 
477 aa  103  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  35.78 
 
 
236 aa  102  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3243  protein serine/threonine phosphatase  30.68 
 
 
267 aa  102  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193605  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  34.89 
 
 
313 aa  102  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3007  protein serine/threonine phosphatase  31.82 
 
 
257 aa  102  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2397  Phosphoprotein phosphatase  31.08 
 
 
246 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  34.43 
 
 
564 aa  101  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  34.65 
 
 
463 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  34.89 
 
 
425 aa  100  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  34.18 
 
 
259 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1774  serine/threonine protein phosphatase-like  35.37 
 
 
264 aa  100  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0461354  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0207  protein serine/threonine phosphatase  31.6 
 
 
269 aa  99.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4487  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.05 
 
 
276 aa  99.8  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  32.8 
 
 
449 aa  99.4  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0666  protein serine/threonine phosphatase  32.81 
 
 
241 aa  99  8e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.719355  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  34.74 
 
 
554 aa  98.6  1e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4547  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.91 
 
 
470 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  36.68 
 
 
395 aa  98.2  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  36.05 
 
 
469 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3336  protein serine/threonine phosphatases  32.5 
 
 
633 aa  98.6  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  36.32 
 
 
463 aa  99  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  29.76 
 
 
250 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.06 
 
 
247 aa  97.8  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  34.7 
 
 
252 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  33.76 
 
 
259 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  29.57 
 
 
250 aa  97.8  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.54 
 
 
438 aa  97.8  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  35.92 
 
 
452 aa  97.8  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3962  protein phosphatase 2C, family protein  29.76 
 
 
250 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3498  protein serine/threonine phosphatase  30.83 
 
 
256 aa  97.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243056  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3187  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
415 aa  97.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000686686  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1861  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.43 
 
 
252 aa  97.4  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  36.2 
 
 
267 aa  96.7  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10018  serine/threonine phosphatase ppp  35.32 
 
 
514 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000837689  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.29 
 
 
517 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  35.34 
 
 
466 aa  96.7  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  30.42 
 
 
472 aa  96.3  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  34.96 
 
 
276 aa  95.9  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2087  Phosphoprotein phosphatase  31.97 
 
 
445 aa  95.9  8e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.799207  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  34.06 
 
 
548 aa  95.9  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3905  protein phosphatase 2C, family protein  29.96 
 
 
250 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  34.06 
 
 
319 aa  95.5  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0808  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.84 
 
 
516 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3686  protein serine/threonine phosphatase  30.16 
 
 
250 aa  95.5  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3911  protein phosphatase 2C, family protein  29.96 
 
 
250 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00759047  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1992  protein phosphatase 2C family protein  30.93 
 
 
239 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1901  protein serine/threonine phosphatase  31.56 
 
 
267 aa  95.5  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1827  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.56 
 
 
267 aa  95.5  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179821  normal  0.768093 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3622  protein phosphatase 2C  28.57 
 
 
250 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2455  protein serine/threonine phosphatase  28.34 
 
 
263 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225644  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  31.67 
 
 
449 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  35.02 
 
 
421 aa  94.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0019  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.39 
 
 
491 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.888724 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0019  protein serine/threonine phosphatases  34.39 
 
 
491 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.678049  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1710  protein phosphatase 2C family protein  30.51 
 
 
239 aa  94  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.39 
 
 
491 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308307  hitchhiker  0.00998453 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  32.31 
 
 
256 aa  93.2  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  35.55 
 
 
507 aa  93.6  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1520  putative phosphoprotein phosphatase  33.05 
 
 
241 aa  93.2  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.101947 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  29.76 
 
 
245 aa  93.2  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.14 
 
 
238 aa  92.8  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2176  protein serine/threonine phosphatase  30.56 
 
 
255 aa  92.4  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  32.76 
 
 
240 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4001  protein phosphatase 2C, family protein  29.18 
 
 
250 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1935  protein serine/threonine phosphatase  32.55 
 
 
321 aa  91.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.709495  hitchhiker  0.0000466361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>