50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1458 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1458  iron-regulated protein A, putative  100 
 
 		 399 aa  801    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.449627  normal  0.841376 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1925  putative iron-regulated protein  80.74 
 
 		 407 aa  578  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2561  putative iron-regulated protein  75.13 
 
 		 400 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1525  putative iron-regulated protein  65.08 
 
 		 428 aa  493  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217885 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3868  Peptidase M75, Imelysin  45.93 
 
 		 441 aa  329  6e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  0.169885 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0883  putative iron-regulated protein A  42.36 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.500561  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4475  hypothetical protein  42.97 
 
 		 445 aa  278  8e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811777 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2833  putative iron-regulated protein A  41.18 
 
 		 431 aa  276  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0600822  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0952  hypothetical protein  42.71 
 
 		 444 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0913  hypothetical protein  42.71 
 
 		 443 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3326  hypothetical protein  42.61 
 
 		 445 aa  276  5e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4488  hypothetical protein  44.59 
 
 		 448 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0979  hypothetical protein  43.49 
 
 		 445 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4939  hypothetical protein  42.86 
 
 		 475 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0666  imelysin  39.11 
 
 		 410 aa  269  8e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.511316  normal  0.787611 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1786  putative iron-regulated protein  42.25 
 
 		 417 aa  268  1e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37840  hypothetical protein  42.78 
 
 		 441 aa  267  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00426998  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56830  metalloproteinase outer membrane  42.23 
 
 		 446 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4366  iron-regulated protein A, putative  42.55 
 
 		 452 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4061  iron-regulated protein A, putative  42.29 
 
 		 458 aa  262  8e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003123  iron-regulated protein A precursor  40.55 
 
 		 420 aa  261  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0643  imelysin  41.13 
 
 		 417 aa  260  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0272375  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02715  hypothetical protein  40.8 
 
 		 423 aa  258  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3529  putative iron-regulated protein  41.49 
 
 		 426 aa  252  8.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0199  putative iron-regulated protein  39.9 
 
 		 441 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1548  imelysin  39.53 
 
 		 422 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4578  hypothetical protein  39.53 
 
 		 424 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.219407 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0335  hypothetical protein  38.8 
 
 		 425 aa  238  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4315  hypothetical protein  39.23 
 
 		 424 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1368  putative lipoprotein  39.05 
 
 		 420 aa  235  1.0000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3028  hypothetical protein  40.18 
 
 		 422 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.395482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2557  putative iron-regulated protein  36.21 
 
 		 431 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000340096  hitchhiker  0.000000144413 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0563  iron-regulated protein  40.45 
 
 		 420 aa  218  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3197  putative iron-regulated protein  35.12 
 
 		 428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767807  normal  0.856839 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2199  imelysin  40.77 
 
 		 422 aa  209  9e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2086  hypothetical protein  35.73 
 
 		 482 aa  204  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1804  imelysin  35.8 
 
 		 480 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2145  hypothetical protein  36.24 
 
 		 486 aa  196  5.000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.952251  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0688  uncharacterized iron-regulated protein  35.44 
 
 		 429 aa  189  8e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  26.55 
 
 		 382 aa  79  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1462  imelysin  26.67 
 
 		 356 aa  72  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0336824  normal  0.0166245 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0722  putative lipoprotein  23.47 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00126841  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3792  putative lipoprotein  24.34 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0694  putative lipoprotein  24.24 
 
 		 381 aa  59.7  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0345  imelysin  23.88 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.10473 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0671  putative lipoprotein  26.83 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0811  putative lipoprotein  23.84 
 
 		 387 aa  55.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208807  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0971  putative lipoprotein  24.44 
 
 		 386 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0240965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0937  putative lipoprotein  24.84 
 
 		 386 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000801975  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1934  hypothetical protein  22.69 
 
 		 368 aa  47.4  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0548586 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>