157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0931 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0931  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  372  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3637  nitroreductase  58.6 
 
 		 192 aa  203  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1661  nitroreductase  55.32 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.923365 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4587  nitroreductase  52.97 
 
 		 228 aa  184  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1008  nitroreductase  43.85 
 
 		 199 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3754  nitroreductase  46.49 
 
 		 220 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.913341  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0434  nitroreductase  54.95 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.751284  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0443  nitroreductase  54.95 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1763  nitroreductase  35.8 
 
 		 190 aa  114  6e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1919  hypothetical protein  35.48 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3592  nitroreductase  36.02 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0449801  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3921  nitroreductase  37.63 
 
 		 300 aa  100  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159011  normal  0.0804264 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1828  nitroreductase  37.5 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3795  nitroreductase  34.76 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000177685 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1061  nitroreductase  33.9 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.425769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22710  hypothetical protein  34.41 
 
 		 186 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1480  nitroreductase  34.22 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0228393  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4506  nitroreductase  33.69 
 
 		 185 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1802  nitroreductase family protein  33.87 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649607  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1354  nitroreductase  33.87 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000836569  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1405  nitroreductase  33.87 
 
 		 185 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000113316  normal  0.729658 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4233  nitroreductase  38.67 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.064349  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0266  nitroreductase  32.07 
 
 		 187 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4012  nitroreductase  33.69 
 
 		 185 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147997  hitchhiker  0.000154736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5206  hypothetical protein  29.12 
 
 		 187 aa  95.5  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1668  nitroreductase  26.37 
 
 		 187 aa  92.4  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145589  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2036  nitroreductase  25.82 
 
 		 187 aa  92.4  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378927  normal  0.848302 
 
 
-
 
NC_004310  BR1069  nitroreductase family protein  29.73 
 
 		 194 aa  90.9  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600572  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1033  nitroreductase family protein  29.73 
 
 		 194 aa  90.9  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.680081  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1495  hypothetical protein  32.07 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0669321 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3262  nitroreductase  28.02 
 
 		 191 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.0279896 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1635  nitroreductase  32.42 
 
 		 187 aa  88.6  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2163  nitroreductase  29.82 
 
 		 169 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0519328 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0953  nitroreductase  33.15 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2674  nitroreductase  30.64 
 
 		 194 aa  87.4  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0050  nitroreductase  40.96 
 
 		 208 aa  86.3  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2747  nitroreductase  31.84 
 
 		 182 aa  86.3  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.501163 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1532  nitroreductase  32.77 
 
 		 182 aa  85.5  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0850  nitroreductase  29.71 
 
 		 191 aa  85.5  4e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.811499  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0968  hypothetical protein  29.71 
 
 		 191 aa  85.5  4e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0909  nitroreductase family protein  30.57 
 
 		 184 aa  85.1  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.968398  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7221  nitroreductase  34.52 
 
 		 221 aa  85.5  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3888  nitroreductase  27.49 
 
 		 169 aa  85.1  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3123  nitroreductase  30.22 
 
 		 187 aa  84.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2220  nitroreductase family protein  27.17 
 
 		 194 aa  84.7  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.605376  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0077  nitroreductase  32.26 
 
 		 196 aa  84.3  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2152  nitroreductase  28.11 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1843  nitroreductase  29.03 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32071  normal  0.0306824 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1056  nitroreductase  29.95 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.545888 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2042  nitroreductase  28.26 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.258273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04578  nitroreductase family  31.07 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1101  nitroreductase  33.14 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0450  nitroreductase  29.03 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1967  hypothetical protein  32.14 
 
 		 183 aa  80.9  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0698  nitroreductase  30.34 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15580  Nitroreductase  36.9 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.978849  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6294  nitroreductase  29.05 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167962  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2199  nitroreductase  31.1 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1833  nitroreductase  32.12 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0967243  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1879  hypothetical protein  31.85 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000572902  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2020  hypothetical protein  30.34 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242439  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1095  nitroreductase  30.99 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.42931 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1800  nitroreductase  31.84 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1800  nitroreductase  29.94 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.493936  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0191  nitroreductase  30.51 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1423  hypothetical protein  31.87 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.566409 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1407  hypothetical protein  31.87 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.348646 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1426  hypothetical protein  30.34 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00297236  normal  0.808801 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01734  predicted oxidoreductase  30.34 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00353733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1877  nitroreductase  30.34 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380394  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2485  hypothetical protein  30.34 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.297695 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01722  hypothetical protein  30.34 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00796019  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1849  hypothetical protein  30.34 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000672951  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1988  hypothetical protein  30.34 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00470911  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1867  hypothetical protein  30.34 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0147803  decreased coverage  0.00000404862 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1618  nitroreductase  32.76 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2050  hypothetical protein  31.21 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.658191  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1390  hypothetical protein  31.21 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.505181 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1740  nitroreductase  30.49 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7274  nitroreductase  40.24 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573924  normal  0.0842376 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1665  nitroreductase  31.14 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002916  protein ydjA  31.17 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1808  nitroreductase  29.38 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2478  nitroreductase  29.38 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.981358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3754  nitroreductase  36.59 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.951056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1971  hypothetical protein  31.21 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1818  nitroreductase  27.72 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1011  nitroreductase  26.32 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0566  hypothetical protein  33.12 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1981  hypothetical protein  31.21 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959579  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1847  nitroreductase  29.38 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2345  hypothetical protein  31.21 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000126395  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2209  hypothetical protein  33.54 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2267  hypothetical protein  31.21 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2090  hypothetical protein  31.21 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.363519  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1923  nitroreductase family protein  33.33 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0762  nitroreductase family protein  33.77 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0775  nitroreductase family protein  33.77 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0671  nitroreductase family protein  32.03 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2043  nitroreductase family protein  33.77 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.144976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>