38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0834 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0834  protein of unknown function DUF354  100 
 
 
361 aa  744    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0488411  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0959  hypothetical protein  50.71 
 
 
368 aa  360  2e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.107791  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1117  hypothetical protein  49.56 
 
 
357 aa  347  2e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0053  hypothetical protein  47.19 
 
 
363 aa  346  4e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2021  hypothetical protein  42.27 
 
 
347 aa  286  5e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3746  hypothetical protein  35.36 
 
 
370 aa  238  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1140  protein of unknown function DUF354  40.53 
 
 
369 aa  235  1.0000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2496  protein of unknown function DUF354  36.73 
 
 
381 aa  231  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3286  protein of unknown function DUF354  42.23 
 
 
355 aa  230  2e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.401712  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2023  protein of unknown function DUF354  36.9 
 
 
379 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0244531  normal  0.923484 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0197  hypothetical protein  34.25 
 
 
374 aa  211  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00000153043  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4579  protein of unknown function DUF354  34.59 
 
 
374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.242869  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0720  hypothetical protein  33.43 
 
 
344 aa  197  3e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0102669  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0433  protein of unknown function DUF354  35.19 
 
 
401 aa  193  4e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0489  protein of unknown function DUF354  31.96 
 
 
355 aa  181  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0677  protein of unknown function DUF354  30.23 
 
 
363 aa  173  3.9999999999999995e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3429  protein of unknown function DUF354  28.77 
 
 
383 aa  157  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5262  protein of unknown function DUF354  28.41 
 
 
369 aa  157  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101581  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3016  protein of unknown function DUF354  26.15 
 
 
367 aa  134  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1090  hypothetical protein  25.45 
 
 
350 aa  75.9  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.399019  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1339  hypothetical protein  23.81 
 
 
335 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00496321  normal  0.353078 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0246  hypothetical protein  23.49 
 
 
337 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1667  hypothetical protein  23.49 
 
 
337 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.251893  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0961  hypothetical protein  23.13 
 
 
337 aa  57  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0085  protein of unknown function DUF354  26.13 
 
 
342 aa  56.6  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0372  hypothetical protein  23.19 
 
 
333 aa  56.2  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.153205 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1755  hypothetical protein  23.08 
 
 
330 aa  52.8  0.000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.387816  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1136  hypothetical protein  22.83 
 
 
329 aa  52.8  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.345385 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1392  hypothetical protein  22.38 
 
 
860 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1073  protein of unknown function DUF354  22.29 
 
 
349 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.266744  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0844  hypothetical protein  22.79 
 
 
338 aa  52  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.504464  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3188  protein of unknown function DUF354  21.97 
 
 
349 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1550  hypothetical protein  21.08 
 
 
337 aa  50.4  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.590415  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0867  hypothetical protein  22.35 
 
 
353 aa  50.4  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.530638  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1596  protein of unknown function DUF354  24.14 
 
 
358 aa  46.2  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1722  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  25.45 
 
 
366 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.000000995327 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2863  hypothetical protein  21.94 
 
 
377 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0255  hypothetical protein  23.95 
 
 
340 aa  44.3  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>