41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8427 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011892  Mnod_8427    100 
 
 
503 bp  997    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.51552  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8409  hypothetical protein  91.28 
 
 
753 bp  599  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  89.29 
 
 
960 bp  555  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8273    89.09 
 
 
753 bp  555  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11171  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  88.02 
 
 
753 bp  509  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1892    89.38 
 
 
753 bp  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  87.6 
 
 
753 bp  492  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  87.1 
 
 
753 bp  476  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4991    88.01 
 
 
752 bp  474  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  86.9 
 
 
753 bp  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0824    87.83 
 
 
522 bp  452  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799947  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1878    86.34 
 
 
972 bp  438  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  85.77 
 
 
741 bp  438  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7883    85.91 
 
 
699 bp  428  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.712837  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5033  hypothetical protein  85.91 
 
 
753 bp  428  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  86.71 
 
 
753 bp  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6405    87.74 
 
 
450 bp  412  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  86.03 
 
 
1041 bp  392  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3376    85.35 
 
 
752 bp  391  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2525    84.86 
 
 
753 bp  385  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8317  hypothetical protein  84.91 
 
 
753 bp  383  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324415  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3932    85.44 
 
 
754 bp  379  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  85.38 
 
 
753 bp  375  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7846  putative insertion sequence transposase-like protein  90.82 
 
 
705 bp  361  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8695    83 
 
 
754 bp  303  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221639  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  87.38 
 
 
684 bp  287  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3233    87.77 
 
 
716 bp  274  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6183    86.42 
 
 
337 bp  274  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8706    82.28 
 
 
456 bp  248  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.767164  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3889    88.27 
 
 
189 bp  170  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333986  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  82.76 
 
 
753 bp  125  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  82.76 
 
 
753 bp  125  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0970    83.33 
 
 
466 bp  111  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2686    82 
 
 
391 bp  111  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6119    84.47 
 
 
105 bp  77.8  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8804    84.47 
 
 
243 bp  77.8  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4993    89.71 
 
 
104 bp  71.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0987    88.24 
 
 
201 bp  71.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721005  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1884    87.1 
 
 
168 bp  60  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  86.36 
 
 
1041 bp  60  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7493    84.42 
 
 
195 bp  58  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>