68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6498 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6498  Animal heme peroxidase  100 
 
 
969 aa  1959    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5884  hypothetical protein  74.77 
 
 
436 aa  624  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.698795  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0533  animal heme peroxidase  43.31 
 
 
531 aa  391  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.89326  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8745  heme peroxidase  41.97 
 
 
528 aa  369  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1624  heme peroxidase  41.24 
 
 
528 aa  355  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1219  Animal heme peroxidase  41.98 
 
 
571 aa  352  2e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3626  heme peroxidase  41.42 
 
 
550 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.897978  normal  0.572751 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3099  prostaglandin-endoperoxide synthase  38.99 
 
 
528 aa  330  7e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.604155  normal  0.0659585 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0615  animal heme peroxidase  39.93 
 
 
527 aa  307  5.0000000000000004e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.272198  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2680  cytochrome P450  23.95 
 
 
443 aa  80.9  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05028  Fatty acid oxygenasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6IYE5]  26.25 
 
 
1117 aa  79.7  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.446409  normal  0.730918 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2669  heme peroxidase  27.32 
 
 
610 aa  77.8  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2423  cytochrome P450  24.18 
 
 
470 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.243249  normal  0.0544032 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2500  Animal heme peroxidase  29.15 
 
 
648 aa  74.3  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.23471  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2966  cytochrome P450  25.85 
 
 
475 aa  73.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.675842  hitchhiker  0.00699967 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01967  Fatty acid oxygenasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6RET3]  19.09 
 
 
1081 aa  72  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.990808  normal  0.262225 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0853  cytochrome P450  26.43 
 
 
459 aa  67.8  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2772  cytochrome P450  22.22 
 
 
448 aa  67  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.686611  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5041  cytochrome P450  24.14 
 
 
328 aa  65.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4693  cytochrome P450  25.6 
 
 
460 aa  62.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0772  cytochrome P450  24.77 
 
 
459 aa  60.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0785  cytochrome P450  24.18 
 
 
447 aa  60.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0800  cytochrome P450  24.18 
 
 
447 aa  60.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00300  sterol 14-demethylase, putative  27.78 
 
 
550 aa  58.9  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0781  cytochrome P450  23.96 
 
 
447 aa  58.9  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.620196  normal  0.775939 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4965  cytochrome P450  32.09 
 
 
451 aa  59.3  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.809651  normal  0.550113 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4670  cytochrome P450  32.09 
 
 
451 aa  59.3  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4119  cytochrome P450  24.19 
 
 
429 aa  58.9  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4582  cytochrome P450  32.09 
 
 
451 aa  59.3  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2227  cytochrome P450  40 
 
 
446 aa  58.9  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.536845  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22260  cytochrome P450  24.6 
 
 
451 aa  57.8  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140076  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5161  cytochrome P450  30.91 
 
 
452 aa  57.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2664  cytochrome P450  24.23 
 
 
441 aa  57  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.100989 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7679  putative cytochrome P450 family protein  28.26 
 
 
453 aa  56.6  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1596  cytochrome P450  31.52 
 
 
452 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4636  cytochrome P450  24.4 
 
 
459 aa  56.2  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_31339  predicted protein  28.08 
 
 
482 aa  55.5  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  25.56 
 
 
468 aa  55.5  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  26.75 
 
 
551 aa  54.7  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01310  Cytochrome P450, putative  25.99 
 
 
582 aa  53.9  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  26.44 
 
 
432 aa  52.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0663  cytochrome P450  29.95 
 
 
469 aa  51.6  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.021645  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2936  peroxidase  23.29 
 
 
714 aa  50.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3794  cytochrome P450  27 
 
 
446 aa  50.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2522  cytochrome P450  30.97 
 
 
1053 aa  49.3  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01087  cytochrome P450 monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03930)  27.59 
 
 
501 aa  49.3  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1573  cytochrome P450  27.72 
 
 
408 aa  48.5  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.595  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02706  cytochrome P450, putative (Eurofung)  29.55 
 
 
506 aa  48.5  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.290091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  33.13 
 
 
457 aa  48.1  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4935  cytochrome P450  27.61 
 
 
480 aa  48.1  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.556694  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5215  cytochrome P450  27.61 
 
 
480 aa  48.1  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1575  hitchhiker  0.00605855 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4847  cytochrome P450  27.61 
 
 
480 aa  48.1  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1356  cytochrome P450  28.37 
 
 
457 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3337  cytochrome P450  28.77 
 
 
464 aa  47.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4108  Cytochrome P450-like protein  27.55 
 
 
527 aa  47.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188763  normal  0.403252 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11142  cytochrome P450, putative (Eurofung)  30 
 
 
549 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4605  cytochrome P450  24.92 
 
 
469 aa  46.2  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.472577  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3843  cytochrome P450  25.78 
 
 
451 aa  46.2  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10647  AhbB [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q67ER5]  29.73 
 
 
570 aa  46.2  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  27.92 
 
 
452 aa  45.8  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1386  cytochrome P450  27.66 
 
 
457 aa  45.8  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  39.44 
 
 
419 aa  45.8  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3723  cytochrome P450  33.33 
 
 
448 aa  45.8  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46438  predicted protein  30.63 
 
 
565 aa  45.4  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16780  hypothetical protein  33.65 
 
 
425 aa  45.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1460  hypothetical protein  33.65 
 
 
425 aa  45.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04042  cytochrome P450, putative (Eurofung)  29.84 
 
 
531 aa  45.1  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5591  cytochrome P450  31.08 
 
 
429 aa  45.1  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.362948  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>