More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5974 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5974  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
244 aa  474  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0830301  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  91.67 
 
 
244 aa  411  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.700079  normal  0.0254377 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1759  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.64 
 
 
244 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.07 
 
 
244 aa  359  2e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.611067  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.07 
 
 
244 aa  359  2e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.5785  normal  0.739795 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2776  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.53 
 
 
245 aa  315  3e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0898999 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.35 
 
 
253 aa  289  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.381458 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.46 
 
 
259 aa  229  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5956  ABC transporter permease  56.96 
 
 
245 aa  226  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.560438  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2356  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.07 
 
 
260 aa  226  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0687  two-component system, permease component  50.62 
 
 
258 aa  225  6e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0143417  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.21 
 
 
285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.64 
 
 
256 aa  206  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1929  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  46.26 
 
 
255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0770518  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0928  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  32.19 
 
 
255 aa  138  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.590061  normal  0.182245 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2358  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  31.38 
 
 
269 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.540869 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 
263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.45 
 
 
263 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  34.43 
 
 
263 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1684  ABC transporter permease  33.85 
 
 
262 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19570  ABC transporter permease  33.33 
 
 
262 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.36 
 
 
263 aa  105  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0565837  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.29 
 
 
265 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.29 
 
 
265 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0722896  normal  0.022026 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.78 
 
 
266 aa  101  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.08 
 
 
265 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.77 
 
 
265 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.0445843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5412  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.25 
 
 
260 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.210037  hitchhiker  0.00191971 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1347  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.11 
 
 
260 aa  98.6  7e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000648082  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  28.94 
 
 
279 aa  98.6  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.61 
 
 
264 aa  97.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.46 
 
 
264 aa  95.5  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  30.46 
 
 
264 aa  95.5  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1283  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  26.61 
 
 
252 aa  94.4  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0507526 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.9 
 
 
268 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00938  alkanesulfonate transporter subunit  33.68 
 
 
263 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.028081  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
263 aa  94  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.753275  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2185  alkanesulfonate transporter permease subunit  33.68 
 
 
264 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.11182  normal  0.890131 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
264 aa  94  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.050552  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1036  alkanesulfonate transporter permease subunit  33.68 
 
 
263 aa  94  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0685931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1043  alkanesulfonate transporter permease subunit  33.68 
 
 
263 aa  94  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00945  hypothetical protein  33.68 
 
 
263 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
264 aa  94  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2662  alkanesulfonate transporter permease subunit  33.68 
 
 
263 aa  94  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.629834  normal  0.0100847 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.29 
 
 
273 aa  92.8  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.64 
 
 
260 aa  92.8  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000143494  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.24 
 
 
263 aa  92.8  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4875  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.66 
 
 
265 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746085  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1096  alkanesulfonate transporter permease subunit  33.16 
 
 
263 aa  92  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00432775  normal  0.422148 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.67 
 
 
283 aa  92  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3008  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.45 
 
 
280 aa  92  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
266 aa  91.3  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  30.17 
 
 
277 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.52 
 
 
265 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2712  sulfonate ABC transporter permease  27.83 
 
 
282 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2920  sulfonate ABC transporter permease protein  27.83 
 
 
282 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5468  ABC transporter membrane spanning protein (aliphatic sulphonate)  32.35 
 
 
284 aa  90.5  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165676  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5315  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  29.66 
 
 
265 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2638  ABC sulfonate transporter, inner membrane subunit  27.83 
 
 
279 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950643  hitchhiker  0.0000361652 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0778  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.84 
 
 
270 aa  89.7  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
272 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.612608  normal  0.0470724 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2500  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  33.69 
 
 
268 aa  89.4  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.02 
 
 
286 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.703431 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1238  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
273 aa  88.6  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.466833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1990  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
273 aa  88.6  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.088895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0780  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
273 aa  88.6  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1557  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
260 aa  88.6  8e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000228451  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
280 aa  88.6  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.42556  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1724  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
273 aa  88.6  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0381  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
273 aa  88.6  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.410212  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1837  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
269 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.669476  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21600  aliphatic sulfonates ABC transporter, inner membrane component  27.16 
 
 
284 aa  87.8  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 
273 aa  88.2  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.5369  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1340  aliphatic sulfonate ABC transporter transmembrane protein  34.48 
 
 
264 aa  87.4  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0574559  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7646  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  29.28 
 
 
282 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0357497  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.08 
 
 
280 aa  87  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3901  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.65 
 
 
255 aa  87.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0566341  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2583  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32 
 
 
289 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1153  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  27.32 
 
 
258 aa  87  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.23101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32 
 
 
289 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128032  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1822  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  32.82 
 
 
269 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32 
 
 
289 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.753313  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2919  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  28.69 
 
 
282 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.35916e-18 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3159  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31 
 
 
293 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2062  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  32.41 
 
 
280 aa  86.3  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.332807  normal  0.624531 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
270 aa  86.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.150226 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.22 
 
 
289 aa  86.3  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.88 
 
 
286 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.75 
 
 
251 aa  85.9  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.88 
 
 
282 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0101223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1556  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  26.54 
 
 
301 aa  85.5  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.88 
 
 
275 aa  85.1  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.06 
 
 
286 aa  85.1  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973794  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1279  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
272 aa  85.5  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88893  normal  0.0504928 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0856  ABC-type transport system, permease component  25.65 
 
 
245 aa  85.1  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.376745  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2959  sulfonate ABC transporter, permease protein, putative  28.27 
 
 
284 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.132224  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1975  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.08 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.59364  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0768  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.47 
 
 
286 aa  85.1  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113876 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.84 
 
 
280 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.09 
 
 
284 aa  84.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0616622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>