23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5889 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5889  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 493 aa  957    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4129  polysaccharide biosynthesis protein  31.18 
 
 		 477 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0847  polysaccharide biosynthesis protein  24.28 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3839  polysaccharide biosynthesis protein  27.86 
 
 		 507 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  23.62 
 
 		 502 aa  57  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3132  polysaccharide biosynthesis protein  23.73 
 
 		 458 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415164  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2583  polysaccharide biosynthesis protein  23.73 
 
 		 458 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2913  polysaccharide biosynthesis protein  23.1 
 
 		 458 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.953336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  27.19 
 
 		 508 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2965  polysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 		 500 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  26.07 
 
 		 483 aa  50.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  22.39 
 
 		 483 aa  50.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  21.43 
 
 		 448 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2723  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 		 458 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180264  normal  0.985794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0998  hypothetical protein  22.25 
 
 		 455 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238749  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  21.07 
 
 		 500 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  23.17 
 
 		 487 aa  47.8  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2873  polysaccharide biosynthesis protein  23.55 
 
 		 500 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354363  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  23.74 
 
 		 507 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  21.71 
 
 		 498 aa  45.8  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  28 
 
 		 503 aa  45.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  22.61 
 
 		 509 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  23.56 
 
 		 493 aa  43.5  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>