50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5379 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5379  protein of unknown function DUF423  100 
 
 		 123 aa  221  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5083  hypothetical protein  73.33 
 
 		 134 aa  105  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225516  normal  0.744804 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3501  hypothetical protein  57.43 
 
 		 127 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610166 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2628  protein of unknown function DUF423  62.5 
 
 		 123 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.382663  normal  0.0718783 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2349  hypothetical protein  63.54 
 
 		 123 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2306  protein of unknown function DUF423  59.35 
 
 		 123 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.454103  normal  0.0930723 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0815  hypothetical protein  47.5 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.837156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7328  hypothetical protein  45.08 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0071  hypothetical protein  45.92 
 
 		 122 aa  67  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00440778 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3445  hypothetical protein  48.7 
 
 		 121 aa  67  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104865  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3362  hypothetical protein  44.14 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.389012 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3298  protein of unknown function DUF423  52.88 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00419882 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3701  hypothetical protein  41.74 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3072  hypothetical protein  38.79 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.628352  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2649  hypothetical protein  46.67 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.831092  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0629  hypothetical protein  56.52 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0634  protein of unknown function DUF423  46.77 
 
 		 122 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0634  hypothetical protein  56.52 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.156601  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0681  hypothetical protein  58.33 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3306  hypothetical protein  31.5 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0654782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1480  hypothetical protein  44.71 
 
 		 166 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3126  hypothetical protein  31.5 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000001734  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3143  hypothetical protein  31.5 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00090815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3191  hypothetical protein  31.5 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0186134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3206  hypothetical protein  31.5 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3262  protein of unknown function DUF423  48.48 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.319272 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2331  hypothetical protein  48.94 
 
 		 122 aa  48.9  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145053  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0881  protein of unknown function DUF423  32.56 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4071  hypothetical protein  32.56 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000289179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3063  hypothetical protein  32.56 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.47901e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02619  hypothetical protein  32.56 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0905  hypothetical protein  32.56 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2948  hypothetical protein  32.56 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000825789  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02658  conserved inner membrane protein  32.56 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3113  hypothetical protein  32.56 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000103813  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2951  hypothetical protein  32.56 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.01255e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2563  hypothetical protein  30.77 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3376  hypothetical protein  30.95 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.432758  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0230  hypothetical protein  27.5 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3011  protein of unknown function DUF423  49.12 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0928  hypothetical protein  30.95 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00438881  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3253  hypothetical protein  28.68 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.222088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2993  hypothetical protein  30.09 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4169  hypothetical protein  36.07 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.338071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2662  hypothetical protein  26.23 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2499  hypothetical protein  31.97 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.300029  decreased coverage  0.000130725 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2762  hypothetical protein  31.4 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.340098  normal  0.38705 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3804  hypothetical protein  31.4 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00311639  unclonable  0.0000000190492 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01185  hypothetical protein  30.95 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2982  hypothetical protein  31.4 
 
 		 128 aa  40  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>