24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3501 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3501  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  228  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610166 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2628  protein of unknown function DUF423  65.04 
 
 		 123 aa  103  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.382663  normal  0.0718783 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2306  protein of unknown function DUF423  64.23 
 
 		 123 aa  102  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.454103  normal  0.0930723 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2349  hypothetical protein  65.04 
 
 		 123 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5379  protein of unknown function DUF423  58.33 
 
 		 123 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5083  hypothetical protein  64.79 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225516  normal  0.744804 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0815  hypothetical protein  50 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.837156 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3445  hypothetical protein  44.72 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104865  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0071  hypothetical protein  49.5 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00440778 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3362  hypothetical protein  43.12 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.389012 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3072  hypothetical protein  39.66 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.628352  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7328  hypothetical protein  45.3 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0634  protein of unknown function DUF423  50 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3298  protein of unknown function DUF423  53.85 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00419882 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2649  hypothetical protein  45.78 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.831092  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3701  hypothetical protein  41.8 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0629  hypothetical protein  41.51 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0634  hypothetical protein  41.51 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.156601  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2331  hypothetical protein  43.55 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0681  hypothetical protein  46.05 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1480  hypothetical protein  43.33 
 
 		 166 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3262  protein of unknown function DUF423  47.17 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.319272 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3011  protein of unknown function DUF423  50 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3376  hypothetical protein  30.23 
 
 		 131 aa  40  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.432758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>