54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2306 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2306  protein of unknown function DUF423  100 
 
 		 123 aa  217  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.454103  normal  0.0930723 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2628  protein of unknown function DUF423  88.62 
 
 		 123 aa  147  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.382663  normal  0.0718783 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2349  hypothetical protein  88.62 
 
 		 123 aa  140  8e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3501  hypothetical protein  64.23 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610166 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5083  hypothetical protein  69.23 
 
 		 134 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225516  normal  0.744804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5379  protein of unknown function DUF423  59.35 
 
 		 123 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0815  hypothetical protein  48.31 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.837156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7328  hypothetical protein  43.44 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0071  hypothetical protein  47.54 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00440778 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3362  hypothetical protein  44.95 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.389012 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3445  hypothetical protein  41.67 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104865  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3072  hypothetical protein  35.29 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.628352  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0634  protein of unknown function DUF423  45.31 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2649  hypothetical protein  45.35 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.831092  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0629  hypothetical protein  44.76 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3701  hypothetical protein  37.29 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3298  protein of unknown function DUF423  50.49 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00419882 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0681  hypothetical protein  47.37 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0634  hypothetical protein  44.76 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.156601  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3505  hypothetical protein  38.94 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.248867  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1480  hypothetical protein  46.34 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2331  hypothetical protein  48.94 
 
 		 122 aa  51.2  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2662  hypothetical protein  29.46 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4468  hypothetical protein  25.2 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3177  hypothetical protein  35.96 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.652307  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3376  hypothetical protein  33.07 
 
 		 131 aa  43.5  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.432758  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2993  hypothetical protein  31.3 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1612  membrane protein DUF423  31.58 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.221104  normal  0.524793 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3262  protein of unknown function DUF423  47.17 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.319272 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2762  hypothetical protein  31.58 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.340098  normal  0.38705 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3011  protein of unknown function DUF423  50 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0692  membrane protein  28.69 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.874009  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0928  hypothetical protein  33.07 
 
 		 131 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00438881  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0328  protein of unknown function DUF423  31.91 
 
 		 159 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.858167  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3902  hypothetical protein  32.2 
 
 		 126 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4169  hypothetical protein  37.72 
 
 		 123 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.338071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3143  hypothetical protein  31.3 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00090815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3126  hypothetical protein  31.3 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000001734  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3306  hypothetical protein  31.3 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0654782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3191  hypothetical protein  31.3 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0186134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3206  hypothetical protein  31.3 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02658  conserved inner membrane protein  32.03 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0881  protein of unknown function DUF423  32.03 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02619  hypothetical protein  32.03 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2951  hypothetical protein  32.03 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.01255e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3113  hypothetical protein  32.03 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000103813  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0905  hypothetical protein  32.03 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2948  hypothetical protein  32.03 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000825789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3063  hypothetical protein  32.03 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.47901e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4071  hypothetical protein  32.03 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000289179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0331  protein of unknown function DUF423  36.14 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.120447 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3320  hypothetical protein  32.46 
 
 		 129 aa  40.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00120689  normal  0.931239 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0152  hypothetical protein  36.14 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.318848  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3804  hypothetical protein  33.61 
 
 		 131 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00311639  unclonable  0.0000000190492 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>