34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3445 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3445  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  226  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104865  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2331  hypothetical protein  52.07 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0815  hypothetical protein  46.09 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.837156 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3072  hypothetical protein  43.59 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.628352  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0071  hypothetical protein  46.32 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00440778 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3262  protein of unknown function DUF423  56.41 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.319272 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3501  hypothetical protein  45.45 
 
 		 127 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610166 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0634  protein of unknown function DUF423  47.37 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2649  hypothetical protein  44.19 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.831092  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3011  protein of unknown function DUF423  52.85 
 
 		 123 aa  63.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3701  hypothetical protein  44.44 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3362  hypothetical protein  42.61 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.389012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0681  hypothetical protein  50 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7328  hypothetical protein  45.3 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2628  protein of unknown function DUF423  41.49 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.382663  normal  0.0718783 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5379  protein of unknown function DUF423  51.09 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2349  hypothetical protein  42.55 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0629  hypothetical protein  44 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0634  hypothetical protein  44 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.156601  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5332  hypothetical protein  34.75 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.423162  normal  0.234903 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4742  hypothetical protein  36.97 
 
 		 126 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0432  hypothetical protein  36.44 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2306  protein of unknown function DUF423  39.36 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.454103  normal  0.0930723 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0478  hypothetical protein  36.13 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324677  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2013  protein of unknown function DUF423  33.33 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04960  hypothetical protein  35.54 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.492917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1079  protein of unknown function DUF423  47.27 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.871958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3298  protein of unknown function DUF423  46.51 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00419882 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0964  hypothetical protein  47.27 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5083  hypothetical protein  60 
 
 		 134 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225516  normal  0.744804 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4169  hypothetical protein  34.45 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.338071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0359  hypothetical protein  30.51 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0692  membrane protein  28.57 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.874009  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004250  hypothetical protein  30 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000539124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>