22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3701 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3701  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  243  8e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3072  hypothetical protein  77.34 
 
 		 134 aa  186  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.628352  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0815  hypothetical protein  55.74 
 
 		 125 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.837156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7328  hypothetical protein  51.26 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0071  hypothetical protein  52.13 
 
 		 122 aa  88.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00440778 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0634  protein of unknown function DUF423  50.43 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3445  hypothetical protein  46.15 
 
 		 121 aa  70.1  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104865  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3501  hypothetical protein  41.84 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610166 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0681  hypothetical protein  55.56 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2628  protein of unknown function DUF423  41.94 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.382663  normal  0.0718783 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3362  hypothetical protein  37.82 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.389012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2349  hypothetical protein  41.94 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2331  hypothetical protein  37.6 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5379  protein of unknown function DUF423  41.74 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2649  hypothetical protein  37.8 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.831092  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2306  protein of unknown function DUF423  37.63 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.454103  normal  0.0930723 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5083  hypothetical protein  43.42 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225516  normal  0.744804 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3298  protein of unknown function DUF423  42.19 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00419882 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0629  hypothetical protein  34.45 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0634  hypothetical protein  34.48 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.156601  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1480  hypothetical protein  38.33 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2013  protein of unknown function DUF423  31.97 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>