31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3011 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3011  protein of unknown function DUF423  100 
 
 
123 aa  230  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3262  protein of unknown function DUF423  91.06 
 
 
123 aa  156  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.319272 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3445  hypothetical protein  52.85 
 
 
121 aa  100  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104865  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2649  hypothetical protein  47.62 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.831092  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3072  hypothetical protein  42.98 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.628352  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2331  hypothetical protein  51.67 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145053  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0815  hypothetical protein  47.79 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.837156 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3362  hypothetical protein  38.21 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.389012 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0629  hypothetical protein  40.34 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0634  hypothetical protein  40.34 
 
 
124 aa  51.6  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.156601  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3501  hypothetical protein  44.44 
 
 
127 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7328  hypothetical protein  41.8 
 
 
123 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0634  protein of unknown function DUF423  40.22 
 
 
122 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0071  hypothetical protein  38.04 
 
 
122 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00440778 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04960  hypothetical protein  37.93 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.492917  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0478  hypothetical protein  37.93 
 
 
125 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324677  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2762  hypothetical protein  34.75 
 
 
129 aa  45.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.340098  normal  0.38705 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0681  hypothetical protein  54.76 
 
 
122 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5332  hypothetical protein  36.36 
 
 
126 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.423162  normal  0.234903 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0432  hypothetical protein  37.38 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4979  hypothetical protein  36.04 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5106  hypothetical protein  36.04 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.167348  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3804  hypothetical protein  30.25 
 
 
131 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00311639  unclonable  0.0000000190492 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4742  hypothetical protein  37.04 
 
 
126 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2628  protein of unknown function DUF423  38.64 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.382663  normal  0.0718783 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2982  hypothetical protein  35.54 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0928  hypothetical protein  28.23 
 
 
131 aa  40.8  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00438881  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3376  hypothetical protein  27.42 
 
 
131 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.432758  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3913  hypothetical protein  34.31 
 
 
122 aa  40.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3701  hypothetical protein  33.63 
 
 
128 aa  40.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2499  hypothetical protein  35.45 
 
 
128 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.300029  decreased coverage  0.000130725 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>