36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7328 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7328  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  232  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0634  protein of unknown function DUF423  63.93 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0815  hypothetical protein  58.06 
 
 		 125 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.837156 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0071  hypothetical protein  63.11 
 
 		 122 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00440778 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3072  hypothetical protein  53.17 
 
 		 134 aa  106  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.628352  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0681  hypothetical protein  63.25 
 
 		 122 aa  84.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3701  hypothetical protein  51.26 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3362  hypothetical protein  43.33 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.389012 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3445  hypothetical protein  45.69 
 
 		 121 aa  67  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104865  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2331  hypothetical protein  43.1 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145053  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0634  hypothetical protein  47.79 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.156601  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2628  protein of unknown function DUF423  42.11 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.382663  normal  0.0718783 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2306  protein of unknown function DUF423  43.44 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.454103  normal  0.0930723 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0629  hypothetical protein  46.9 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3501  hypothetical protein  41 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610166 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2349  hypothetical protein  42.11 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2649  hypothetical protein  57.45 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.831092  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1480  hypothetical protein  46.34 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5379  protein of unknown function DUF423  45.63 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3298  protein of unknown function DUF423  52.54 
 
 		 131 aa  49.7  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00419882 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1612  membrane protein DUF423  32.17 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.221104  normal  0.524793 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3262  protein of unknown function DUF423  40.62 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.319272 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4169  hypothetical protein  37.01 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.338071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5156  hypothetical protein  35.83 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.444342  normal  0.879938 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3011  protein of unknown function DUF423  46.94 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0359  hypothetical protein  35 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5083  hypothetical protein  43.48 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225516  normal  0.744804 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5106  hypothetical protein  35 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.167348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4979  hypothetical protein  35 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2499  hypothetical protein  30.77 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.300029  decreased coverage  0.000130725 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0692  membrane protein  32.48 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.874009  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04960  hypothetical protein  34.71 
 
 		 125 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.492917  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0432  hypothetical protein  35 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2993  hypothetical protein  28.57 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0478  hypothetical protein  36.36 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324677  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4742  hypothetical protein  35 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.24559 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>