35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0634 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0634  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  242  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.156601  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0629  hypothetical protein  99.19 
 
 		 139 aa  241  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2649  hypothetical protein  74.14 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.831092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7328  hypothetical protein  48.62 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3362  hypothetical protein  40.57 
 
 		 132 aa  62  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.389012 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3445  hypothetical protein  44 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104865  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3501  hypothetical protein  47.73 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610166 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0071  hypothetical protein  45.88 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00440778 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0815  hypothetical protein  41.59 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.837156 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3072  hypothetical protein  39.25 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.628352  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2628  protein of unknown function DUF423  47.56 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.382663  normal  0.0718783 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4468  hypothetical protein  29.75 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3298  protein of unknown function DUF423  55.81 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00419882 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3262  protein of unknown function DUF423  48 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.319272 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0634  protein of unknown function DUF423  42.86 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3011  protein of unknown function DUF423  44 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5083  hypothetical protein  45.33 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225516  normal  0.744804 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0355  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000016256  hitchhiker  0.000400939 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5379  protein of unknown function DUF423  43.48 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2349  hypothetical protein  43.9 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2331  hypothetical protein  35.29 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1480  hypothetical protein  42.37 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0681  hypothetical protein  57.89 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0478  hypothetical protein  32.2 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324677  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4169  hypothetical protein  36 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.338071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2306  protein of unknown function DUF423  40.74 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.454103  normal  0.0930723 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04960  hypothetical protein  34.18 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.492917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2499  hypothetical protein  30.51 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.300029  decreased coverage  0.000130725 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3701  hypothetical protein  46.15 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5106  hypothetical protein  29.47 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.167348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4979  hypothetical protein  29.47 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1365  hypothetical protein  29.36 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1079  protein of unknown function DUF423  32.26 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.871958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3902  hypothetical protein  28.93 
 
 		 126 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0230  hypothetical protein  35.29 
 
 		 123 aa  40  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>