121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2563 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2563  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  270  5.000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2762  hypothetical protein  46.09 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.340098  normal  0.38705 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3469  hypothetical protein  49.22 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0108117  hitchhiker  0.000383928 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2781  hypothetical protein  46.56 
 
 		 126 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.650934  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2982  hypothetical protein  46.56 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3320  hypothetical protein  48.44 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00120689  normal  0.931239 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1366  hypothetical protein  47.66 
 
 		 130 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0307163  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1352  hypothetical protein  47.66 
 
 		 130 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.679146  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1391  hypothetical protein  47.66 
 
 		 130 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.129642 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2994  protein of unknown function DUF423  47.66 
 
 		 130 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103925  hitchhiker  0.00000155548 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2201  hypothetical protein  51.3 
 
 		 123 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414248  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1284  hypothetical protein  46.88 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00814173  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0359  hypothetical protein  49.6 
 
 		 123 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117527  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5106  hypothetical protein  46.4 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.167348  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5073  hypothetical protein  45.38 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000730403  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5090  hypothetical protein  44.54 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000494012  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4169  hypothetical protein  46.03 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.338071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4979  hypothetical protein  46.4 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5185  hypothetical protein  44.54 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5515  hypothetical protein  44.54 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5436  hypothetical protein  44.54 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5487  hypothetical protein  44.54 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5521  hypothetical protein  43.7 
 
 		 122 aa  104  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0478  hypothetical protein  47.2 
 
 		 125 aa  104  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324677  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5571  hypothetical protein  43.7 
 
 		 122 aa  104  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3913  hypothetical protein  43.7 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1535  hypothetical protein  50.44 
 
 		 130 aa  103  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5243  hypothetical protein  44.54 
 
 		 122 aa  103  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5642  hypothetical protein  44.54 
 
 		 122 aa  103  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04960  hypothetical protein  46.4 
 
 		 125 aa  103  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.492917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5156  hypothetical protein  46.4 
 
 		 123 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.444342  normal  0.879938 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2892  hypothetical protein  49.56 
 
 		 130 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000389686  hitchhiker  0.00000482381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5332  hypothetical protein  46.15 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.423162  normal  0.234903 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2793  hypothetical protein  49.56 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00315578  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2427  hypothetical protein  50 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2722  hypothetical protein  48.67 
 
 		 130 aa  100  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000162987  normal  0.0799022 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3505  hypothetical protein  45.22 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.248867  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0419  hypothetical protein  49.12 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000652034  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01185  hypothetical protein  46.27 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1031  hypothetical protein  45.24 
 
 		 125 aa  100  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0440942  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004250  hypothetical protein  44.78 
 
 		 132 aa  100  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000539124  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4914  protein of unknown function DUF423  47.97 
 
 		 124 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.65781 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2261  protein of unknown function DUF423  44.09 
 
 		 125 aa  99.4  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.328273  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2407  hypothetical protein  40.32 
 
 		 128 aa  99.4  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0637  protein of unknown function DUF423  45.31 
 
 		 125 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.313668 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1549  protein of unknown function DUF423  42.86 
 
 		 127 aa  97.1  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285438  normal  0.221976 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0692  membrane protein  43.22 
 
 		 128 aa  96.7  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.874009  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0432  hypothetical protein  44.8 
 
 		 126 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3902  hypothetical protein  41.27 
 
 		 126 aa  93.6  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4742  hypothetical protein  44.62 
 
 		 126 aa  93.2  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0895  protein of unknown function DUF423  45.95 
 
 		 120 aa  93.6  9e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02960  hypothetical protein  44.8 
 
 		 125 aa  92.8  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4468  hypothetical protein  36.51 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6267  protein of unknown function DUF423  40.48 
 
 		 131 aa  90.1  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.015945  normal  0.442233 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3593  hypothetical protein  44.17 
 
 		 123 aa  90.5  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000700464  normal  0.124416 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2499  hypothetical protein  38.28 
 
 		 128 aa  90.1  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.300029  decreased coverage  0.000130725 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2662  hypothetical protein  42.4 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0331  protein of unknown function DUF423  37.82 
 
 		 125 aa  88.2  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.120447 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0152  hypothetical protein  37.82 
 
 		 127 aa  88.2  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.318848  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1195  hypothetical protein  39.06 
 
 		 126 aa  87.8  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.991321  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3368  protein of unknown function DUF423  42.86 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00388391  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02564  uncharacterized small membrane protein  39.32 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00480554  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3413  hypothetical protein  39.02 
 
 		 126 aa  83.6  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2079  hypothetical protein  36.44 
 
 		 138 aa  83.6  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3149  hypothetical protein  34.62 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08455  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0328  protein of unknown function DUF423  35.66 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.858167  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3477  protein of unknown function DUF423  41.18 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0606  hypothetical protein  37.29 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0620  hypothetical protein  37.29 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.720124  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0621  protein of unknown function DUF423  44.53 
 
 		 125 aa  76.6  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0230  hypothetical protein  36.59 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2013  protein of unknown function DUF423  38.94 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1612  membrane protein DUF423  36.84 
 
 		 137 aa  72  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.221104  normal  0.524793 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3804  hypothetical protein  34.35 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00311639  unclonable  0.0000000190492 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3207  hypothetical protein  35.66 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1365  hypothetical protein  31.85 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0764  hypothetical protein  34.45 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3376  hypothetical protein  32.82 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.432758  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4023  hypothetical protein  38.46 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.343948  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0402  hypothetical protein  40.65 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.151461  hitchhiker  0.000250509 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0226  hypothetical protein  32.5 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0928  hypothetical protein  32.82 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00438881  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1117  protein of unknown function DUF423  34.65 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0206789  normal  0.818653 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3206  hypothetical protein  35.29 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3191  hypothetical protein  35.29 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0186134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3143  hypothetical protein  35.29 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00090815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3126  hypothetical protein  35.29 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000001734  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3306  hypothetical protein  35.29 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0654782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0206  hypothetical protein  32.5 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000028641  hitchhiker  0.0000951882 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0355  hypothetical protein  31.67 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000016256  hitchhiker  0.000400939 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1603  hypothetical protein  38.05 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0698  hypothetical protein  38.14 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3177  hypothetical protein  35.34 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.652307  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3253  hypothetical protein  34.45 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.222088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2993  hypothetical protein  32.82 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01660  hypothetical protein  29.6 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.228945  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0890  protein of unknown function DUF423  37.96 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.928423 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0764  hypothetical protein  37.17 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0881  protein of unknown function DUF423  32.77 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2951  hypothetical protein  32.77 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.01255e-20  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>