22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4701 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4701  aminoacyl-tRNA synthetase class I  100 
 
 		 407 aa  813    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0319438  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5903  hypothetical protein  35.66 
 
 		 417 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2052  hypothetical protein  33.07 
 
 		 418 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0137  hypothetical protein  33.25 
 
 		 403 aa  138  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3920  hypothetical protein  31.16 
 
 		 418 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186757  normal  0.0767976 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0611  hypothetical protein  26.29 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19142  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3796  hypothetical protein  24.51 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4937  hypothetical protein  25.75 
 
 		 440 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  48.28 
 
 		 356 aa  52.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1038  hypothetical protein  52 
 
 		 298 aa  48.5  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  25.78 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  32.62 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1750  hypothetical protein  27.41 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2655  hypothetical protein  38.03 
 
 		 412 aa  47  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3336  hypothetical protein  26.29 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1496  hypothetical protein  29.65 
 
 		 427 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0583  hypothetical protein  41.38 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2084  hypothetical protein  23.89 
 
 		 463 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.446219  normal  0.0261738 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3896  hypothetical protein  22.7 
 
 		 473 aa  44.3  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27072  normal  0.662181 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2684  hypothetical protein  25.8 
 
 		 429 aa  44.3  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0537  hypothetical protein  24.3 
 
 		 480 aa  43.5  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  39.66 
 
 		 434 aa  43.1  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>