25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4007 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4007  LRV FeS4 cluster domain protein  100 
 
 		 211 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3600  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  80.88 
 
 		 250 aa  261  4.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643616  normal  0.0317747 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0138  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  60.89 
 
 		 255 aa  219  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.611555 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0400  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  46.15 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0208  leucine-rich repeat-containing protein  45.05 
 
 		 263 aa  156  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00966126  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0395  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  42.27 
 
 		 268 aa  156  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1242  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  46.77 
 
 		 277 aa  154  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0115  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  43.15 
 
 		 259 aa  154  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0545  hypothetical protein  48.47 
 
 		 255 aa  147  9e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.292881  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2196  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  48.47 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0963  FeS4 cluster protein  44.9 
 
 		 265 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5900  hypothetical protein  46.19 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0217086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1067  LRV FeS4 cluster  43.43 
 
 		 268 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3642  LRV FeS4 cluster domain protein  42.65 
 
 		 283 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5107  LRV FeS4 cluster domain protein  44.39 
 
 		 261 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1578  leucine-rich repeat-containing protein  46.07 
 
 		 279 aa  134  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.521307 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0996  leucine-rich repeat-containing protein  43.46 
 
 		 274 aa  134  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1408  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  42.63 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1250  LRV FeS4 cluster domain protein  41.88 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1534  leucine rich repeat protein  41.88 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.461611  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1449  hypothetical protein  44.5 
 
 		 278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056877 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1574  LRV FeS4 cluster domain protein  41.82 
 
 		 268 aa  121  9e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1408  leucine-rich repeat-containing protein  39.89 
 
 		 252 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.558669  normal  0.105067 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2116  leucine-rich repeat-containing protein  39.89 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01440  Nitrogen fixing leucine rich variant repeat 4Fe-4S cluster protein  35.65 
 
 		 244 aa  95.5  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>