More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1956 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1956  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
443 aa  889    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3818  glycosyl transferase group 1  89.73 
 
 
413 aa  696    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1254  glycosyl transferase group 1  57.56 
 
 
413 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1625  glycosyltransferase  54.39 
 
 
407 aa  444  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764414  normal  0.185019 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4925  glycosyl transferase, group 1  57.28 
 
 
409 aa  432  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0552  glycosyl transferase, group 1  52.85 
 
 
455 aa  426  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410076  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0447  hypothetical protein  51.58 
 
 
412 aa  427  1e-118  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.607814  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1066  glycosyl transferase, group 1  52.11 
 
 
453 aa  425  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2591  glycosyl transferase group 1  53.51 
 
 
410 aa  418  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1873  glycosyl transferase group 1  52.83 
 
 
428 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113427  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0559  glycosyl transferase, group 1  51.06 
 
 
420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.34709 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0700  glycosyltransferase  56 
 
 
407 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2355  glycosyl transferase, group 1  56 
 
 
407 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.359383  normal  0.146668 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0530  glycosyl transferase, group 1  55.53 
 
 
407 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.307998 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0219  putative glycosyltransferase  48.43 
 
 
415 aa  394  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2318  glycosyl transferase, group 1  49.63 
 
 
406 aa  392  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1739  glycosyl transferase, group 1  50.92 
 
 
402 aa  390  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21031  glycosyltransferase  44.01 
 
 
407 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1803  glycosyl transferase, group 1  50.61 
 
 
405 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.143321 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3962  glycosyl transferase group 1  48.54 
 
 
411 aa  368  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114116  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1248  glycosyl transferase group 1  45.83 
 
 
405 aa  362  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0078  glycosyl transferase, group 1  44.93 
 
 
432 aa  352  1e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.938289  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01271  glycosyltransferase  47.93 
 
 
385 aa  350  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1356  glycosyl transferase, group 1  44.12 
 
 
423 aa  350  4e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.699846  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0365  hypothetical protein  49.74 
 
 
369 aa  345  1e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.309757  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4003  glycosyl transferase, group 1  46.32 
 
 
406 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0629  glycosyl transferase group 1  47.24 
 
 
408 aa  340  2.9999999999999998e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3088  glycosyl transferase, group 1  43.3 
 
 
402 aa  338  9e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.708464  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1893  glycosyl transferase, group 1  45.75 
 
 
460 aa  333  4e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2766  putative glycosyltransferase  43.36 
 
 
437 aa  311  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0503  glycosyl transferase group 1  40.93 
 
 
403 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3858  glycosyl transferase, group 1  43.56 
 
 
417 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2888  glycosyl transferase group 1  47.06 
 
 
425 aa  309  6.999999999999999e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378477  normal  0.0208188 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3439  glycosyl transferase group 1  43.24 
 
 
406 aa  301  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4715  glycosyl transferase group 1  44.5 
 
 
415 aa  293  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0188107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2376  glycosyl transferase group 1  43.38 
 
 
412 aa  291  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0578  glycosyl transferase, group 1  43.29 
 
 
518 aa  289  8e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.941896  normal  0.221198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2683  glycosyl transferase group 1  43.98 
 
 
412 aa  278  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0109  glycosyltransferase  37.5 
 
 
401 aa  276  5e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.927996  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2461  glycosyl transferase group 1  43.64 
 
 
390 aa  260  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0111  glycosyltransferase  34.18 
 
 
401 aa  235  9e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.451915  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0638  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 
406 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01261  hypothetical protein  29.28 
 
 
412 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4431  glycosyl transferase group 1  56.56 
 
 
188 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4495  glycosyl transferase group 1  56.56 
 
 
188 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0991  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.65 
 
 
421 aa  96.7  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 
407 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2061  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 
418 aa  71.2  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  31.29 
 
 
402 aa  65.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  33.17 
 
 
388 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 
387 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 
386 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  27.54 
 
 
466 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
440 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.72 
 
 
360 aa  61.6  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 
387 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 
410 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 
405 aa  60.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 
415 aa  60.8  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 
377 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2134  glycosyl transferase group 1  35.38 
 
 
370 aa  60.8  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
413 aa  60.5  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 
401 aa  60.5  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 
458 aa  59.7  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  28.19 
 
 
406 aa  59.7  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0299  glycosyl transferase, group 1  26.71 
 
 
384 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120418  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  29.96 
 
 
370 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 
380 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 
426 aa  59.7  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
434 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0185  glycosyl transferase, group 1  48.48 
 
 
385 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.634207 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 
376 aa  57.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 
416 aa  58.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 
448 aa  57.8  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  27.35 
 
 
480 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3803  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
406 aa  57.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.551552 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1640  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 
384 aa  57.4  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  27.45 
 
 
397 aa  57.4  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  33.82 
 
 
411 aa  57  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  29.22 
 
 
411 aa  57  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 
380 aa  57  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 
399 aa  57  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  33.48 
 
 
442 aa  56.6  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 
374 aa  56.6  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  29.15 
 
 
427 aa  56.6  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1724  glycosyl transferase, group 1  26.73 
 
 
383 aa  56.6  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4293  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 
439 aa  56.2  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
419 aa  56.6  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  31.85 
 
 
382 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0358  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 
310 aa  55.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  30.92 
 
 
375 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  28.37 
 
 
404 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
672 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
377 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  27.76 
 
 
395 aa  55.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 
395 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
377 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 
405 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  25.79 
 
 
416 aa  54.3  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  29.47 
 
 
375 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>