35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0520 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0520  regulatory protein RecX  100 
 
 		 206 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697996  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2037  regulatory protein RecX  77.49 
 
 		 200 aa  222  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3541  hypothetical protein  62.21 
 
 		 178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.795937 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0639  regulatory protein RecX  47.37 
 
 		 198 aa  117  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2303  hypothetical protein  50 
 
 		 211 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100929  hitchhiker  0.00859816 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2260  regulatory protein RecX  51.96 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.442098 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2558  hypothetical protein  43.37 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.173611 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2578  hypothetical protein  49.69 
 
 		 160 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.564298  normal  0.458172 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4526  recombination regulator RecX  33.78 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4261  recombination regulator RecX  33.11 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.288884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3064  hypothetical protein  41.24 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5814  recombination regulator RecX  39.5 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.449871  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3614  regulatory protein RecX  36.69 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0968404  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1418  hypothetical protein  34.08 
 
 		 226 aa  61.2  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0822  hypothetical protein  35.2 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  37.35 
 
 		 168 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  43.36 
 
 		 186 aa  51.6  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  35.29 
 
 		 184 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  38.52 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  30.77 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  39.2 
 
 		 160 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  36.36 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  33.12 
 
 		 222 aa  45.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0703  regulatory protein RecX  27.73 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10540  hypothetical protein  38.22 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0997  recombination regulator RecX  29.63 
 
 		 162 aa  43.1  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.297747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  36.44 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  35.95 
 
 		 338 aa  42.7  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  34.81 
 
 		 217 aa  42.4  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  33.01 
 
 		 199 aa  42  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  29.29 
 
 		 150 aa  41.6  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3239  recombination regulator RecX  27.63 
 
 		 182 aa  41.6  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00185832  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  35.44 
 
 		 202 aa  41.6  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  37.39 
 
 		 163 aa  41.6  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3374  recombination regulator RecX  27.63 
 
 		 187 aa  41.6  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>