152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0166 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0166  protein of unknown function DUF482  100 
 
 
405 aa  822    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0717665  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4593  hypothetical protein  88.86 
 
 
405 aa  741    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2322  hypothetical protein  73.38 
 
 
427 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.483949 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4685  protein of unknown function DUF482  71.36 
 
 
406 aa  587  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3312  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4316  hypothetical protein  71.11 
 
 
406 aa  586  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4833  protein of unknown function DUF482  71.86 
 
 
406 aa  566  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261808  normal  0.379038 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4753  hypothetical protein  60.4 
 
 
402 aa  495  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.51971 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2406  hypothetical protein  59.41 
 
 
411 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.688762  normal  0.186145 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2533  hypothetical protein  60.93 
 
 
402 aa  483  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.941945  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1665  hypothetical protein  59.05 
 
 
418 aa  479  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.750799  normal  0.0965206 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1377  hypothetical protein  64.23 
 
 
397 aa  481  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1121  hypothetical protein  60.61 
 
 
395 aa  478  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.702528  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3791  hypothetical protein  61.42 
 
 
390 aa  477  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1425  hypothetical protein  56.79 
 
 
414 aa  473  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.625932  normal  0.472174 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3548  protein of unknown function DUF482  62.92 
 
 
409 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459173  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3315  hypothetical protein  63.59 
 
 
406 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.479503  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2802  hypothetical protein  59.43 
 
 
398 aa  471  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0294833  normal  0.670826 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3045  hypothetical protein  63.48 
 
 
411 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0745  protein of unknown function DUF482  59.17 
 
 
413 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00828305 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1575  protein of unknown function DUF482  58.57 
 
 
396 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.645858  normal  0.365702 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2450  hypothetical protein  56.23 
 
 
417 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.456626  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1772  protein of unknown function DUF482  57.8 
 
 
396 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118924  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1167  hypothetical protein  56.64 
 
 
395 aa  456  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0877771  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1124  hypothetical protein  56.64 
 
 
395 aa  456  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.326303  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2025  hypothetical protein  56.57 
 
 
405 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2734  hypothetical protein  55.41 
 
 
385 aa  424  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1114  protein of unknown function DUF482  55.61 
 
 
392 aa  417  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.333144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2475  hypothetical protein  53.89 
 
 
395 aa  410  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.407377  normal  0.0590595 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3142  hypothetical protein  59.4 
 
 
386 aa  408  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0531471 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2786  hypothetical protein  57.03 
 
 
381 aa  404  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3103  hypothetical protein  55.41 
 
 
376 aa  400  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.73421  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0252  hypothetical protein  55.41 
 
 
393 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0896  hypothetical protein  53.16 
 
 
414 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2555  hypothetical protein  53.16 
 
 
414 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2105  hypothetical protein  53.73 
 
 
438 aa  395  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1294  hypothetical protein  52.05 
 
 
393 aa  388  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.724983  normal  0.811045 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0135  protein of unknown function DUF482  51.03 
 
 
406 aa  385  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0437  hypothetical protein  48.96 
 
 
387 aa  382  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2458  hypothetical protein  50 
 
 
423 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3005  hypothetical protein  54.8 
 
 
383 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2871  hypothetical protein  45.13 
 
 
388 aa  344  1e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1425  hypothetical protein  45.99 
 
 
374 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.345024 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19080  hypothetical protein  48.07 
 
 
374 aa  335  7.999999999999999e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1249  hypothetical protein  47.56 
 
 
374 aa  335  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.25813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1347  hypothetical protein  45.24 
 
 
394 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4050  hypothetical protein  46.44 
 
 
375 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4543  hypothetical protein  44.99 
 
 
403 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3837  hypothetical protein  45.91 
 
 
375 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29195  normal  0.855927 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3828  hypothetical protein  44.22 
 
 
375 aa  315  6e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210412  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22410  hypothetical protein  45.88 
 
 
374 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000252116 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4092  hypothetical protein  42.89 
 
 
375 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1930  hypothetical protein  39.75 
 
 
405 aa  311  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0856188 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1896  hypothetical protein  48.31 
 
 
374 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0804  hypothetical protein  44.25 
 
 
402 aa  310  4e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2534  hypothetical protein  43.19 
 
 
384 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0657  hypothetical protein  44.3 
 
 
373 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0822  hypothetical protein  41.24 
 
 
390 aa  302  7.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.295229  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3011  hypothetical protein  43.73 
 
 
392 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350718  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1586  hypothetical protein  43.73 
 
 
392 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215515  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1241  hypothetical protein  44.25 
 
 
464 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2273  hypothetical protein  43.73 
 
 
392 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1083  hypothetical protein  44.25 
 
 
441 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1088  hypothetical protein  44.25 
 
 
441 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267189  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0740  hypothetical protein  43.73 
 
 
441 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.391728  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5740  hypothetical protein  43.62 
 
 
392 aa  299  7e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1758  protein of unknown function DUF482  44.04 
 
 
426 aa  298  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0881  hypothetical protein  45.41 
 
 
410 aa  295  9e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642732  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2417  hypothetical protein  43.33 
 
 
392 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.673667  normal  0.0190965 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1140  hypothetical protein  37.19 
 
 
394 aa  292  7e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2323  hypothetical protein  43.59 
 
 
392 aa  292  7e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.471895  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3397  hypothetical protein  42.04 
 
 
389 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.6252  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0877  hypothetical protein  43.08 
 
 
392 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1801  hypothetical protein  42.82 
 
 
392 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2413  hypothetical protein  42.82 
 
 
392 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1444  protein of unknown function DUF482  39.86 
 
 
411 aa  290  4e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1715  hypothetical protein  44.85 
 
 
377 aa  288  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1116  protein of unknown function DUF482  41.78 
 
 
389 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.492606  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2458  hypothetical protein  43.6 
 
 
374 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3841  hypothetical protein  39.32 
 
 
416 aa  286  4e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.614644  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2007  protein of unknown function DUF482  40.62 
 
 
392 aa  285  7e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2170  hypothetical protein  41.93 
 
 
390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164145  hitchhiker  0.00000155889 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1865  hypothetical protein  38.48 
 
 
406 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.164344  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3017  hypothetical protein  39.2 
 
 
384 aa  280  4e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2969  hypothetical protein  42.67 
 
 
381 aa  280  4e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3885  protein of unknown function DUF482  40.29 
 
 
411 aa  278  9e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.854025  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2359  protein of unknown function DUF482  39.5 
 
 
393 aa  276  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.597494  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2611  hypothetical protein  40.69 
 
 
415 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3121  hypothetical protein  41.28 
 
 
438 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2348  hypothetical protein  41.52 
 
 
408 aa  272  8.000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.291454  normal  0.220022 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2114  hypothetical protein  40.1 
 
 
391 aa  271  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0393548 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2329  hypothetical protein  39.13 
 
 
392 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.653635  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2157  hypothetical protein  37.27 
 
 
455 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.391826  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0679  hypothetical protein  40.84 
 
 
400 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01036  hypothetical protein  39.18 
 
 
388 aa  268  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479769  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06130  hypothetical protein  39.18 
 
 
388 aa  268  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.187585  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2563  protein of unknown function DUF482  40.31 
 
 
410 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.871216  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1708  hypothetical protein  39.01 
 
 
418 aa  265  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1793  hypothetical protein  40.41 
 
 
382 aa  264  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426104  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1930  protein of unknown function DUF482  41.3 
 
 
374 aa  264  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.207995 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2296  hypothetical protein  39.09 
 
 
421 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.124232  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>