More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1446 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1446  response regulator receiver protein  100 
 
 		 261 aa  510  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1464  response regulator receiver protein  100 
 
 		 261 aa  510  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2842  response regulator receiver protein  58.73 
 
 		 292 aa  249  5e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4558  response regulator receiver protein  54.3 
 
 		 248 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0901  response regulator receiver protein  56.09 
 
 		 230 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5289  response regulator receiver protein  56.52 
 
 		 230 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.125341 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5719  response regulator receiver protein  56.52 
 
 		 230 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3653  response regulator receiver protein  56.52 
 
 		 230 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4523  two component transcriptional regulator  38.79 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  35.98 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5309  two component transcriptional regulator  35.98 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383621  normal  0.611504 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5700  two component transcriptional regulator  35.98 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663569  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1834  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131317  normal  0.194802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0893  two component transcriptional regulator  38.49 
 
 		 251 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4566  two component transcriptional regulator  38.56 
 
 		 248 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1439  two component transcriptional regulator  37.08 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293954  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1457  two component transcriptional regulator  37.08 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2838  two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.692986  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  35.09 
 
 		 233 aa  98.2  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2935  two component transcriptional regulator  38.16 
 
 		 263 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2905  two component transcriptional regulator  38.16 
 
 		 263 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2949  two component transcriptional regulator  38.16 
 
 		 263 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18360  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.37 
 
 		 239 aa  95.5  8e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3887  two component transcriptional regulator  37.08 
 
 		 251 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04920  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.09 
 
 		 222 aa  93.6  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4507  two component transcriptional regulator  32.3 
 
 		 246 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.21 
 
 		 227 aa  89  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.18 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.63 
 
 		 230 aa  87.8  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3537  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.91 
 
 		 237 aa  87  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.555413 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3676  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.47 
 
 		 243 aa  86.7  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.04 
 
 		 239 aa  86.7  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2321  two component transcriptional regulator  30.3 
 
 		 244 aa  86.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2121  osmolarity response regulator  31.06 
 
 		 248 aa  85.5  9e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.201602  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0509  two component transcriptional regulator  30.74 
 
 		 232 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1276  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.78 
 
 		 242 aa  85.1  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09340  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.48 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.763127 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4285  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.02 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83647  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0669  two component transcriptional regulator  31.9 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.851863  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  33.2 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  28.7 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  28.7 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  34.63 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1714  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.07 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  28.26 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.76 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2540  two component transcriptional regulator  34.63 
 
 		 228 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  31.42 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.49 
 
 		 231 aa  82  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  31.42 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.77 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1546  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.09 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  29.18 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  29.18 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.06 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  29.18 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0042  response regulator  31.06 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.382747  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  29.18 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5611  two component transcriptional regulator  32.28 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0731674  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3070  two component transcriptional regulator  32.17 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  28.33 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3815  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.91 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  29.18 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2200  two component transcriptional regulator  32.8 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  29.18 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  30 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  29.18 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  29.18 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0126  osmolarity response regulator  30.21 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  29.18 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0135  osmolarity response regulator  30.21 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  29.18 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.19 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2322  two component transcriptional regulator  32.8 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  33.05 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  33.68 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6788  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.19 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.241896 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  29.18 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4253  two component transcriptional regulator  33.77 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.18 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0624  two component transcriptional regulator  31.3 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2514  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.75 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.24701  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4249  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.46 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.316157  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  33.68 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30940  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  32.46 
 
 		 225 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  27.71 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3086  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.76 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.151774  normal  0.916258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1549  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0273908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  33.68 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0923  two-component response regulator; MrsR2 protein  25.11 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.227452  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.76 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0906  response regulator  25.11 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  36.29 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0994  two component transcriptional regulator  32.28 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2598  two component transcriptional regulator  36.67 
 
 		 134 aa  77.4  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.157515  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  28.14 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.62 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.07 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0276045  hitchhiker  9.727110000000001e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>