More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3437 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3437  potassium transporter peripheral membrane component  100 
 
 		 452 aa  910    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3218  potassium transporter peripheral membrane component  35.86 
 
 		 454 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.715113  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1970  potassium transporter peripheral membrane component  31.18 
 
 		 453 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.616677  normal  0.0915611 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  33.56 
 
 		 457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  33.33 
 
 		 457 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  33.33 
 
 		 457 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0084  potassium transporter peripheral membrane component  33.33 
 
 		 457 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.409393  hitchhiker  0.00000000549949 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  32.08 
 
 		 457 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  33.56 
 
 		 457 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  31.94 
 
 		 457 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  32.23 
 
 		 458 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  31.72 
 
 		 457 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  30.13 
 
 		 465 aa  212  9e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  31.59 
 
 		 458 aa  211  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2455  potassium transporter peripheral membrane component  30.22 
 
 		 452 aa  207  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341783  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  32.19 
 
 		 457 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  30.21 
 
 		 449 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0734  TrkA-N domain protein  31.33 
 
 		 450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  31.96 
 
 		 457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2085  TrkA-N domain protein  32.51 
 
 		 444 aa  200  3.9999999999999996e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  31.29 
 
 		 457 aa  199  7e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3020  potassium transporter peripheral membrane component  31.66 
 
 		 457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  30.58 
 
 		 458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  30.58 
 
 		 458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  30.58 
 
 		 458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12243  putative potassium uptake protein  28.22 
 
 		 449 aa  196  9e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4126  potassium transporter peripheral membrane component  31.52 
 
 		 458 aa  196  9e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  29.3 
 
 		 458 aa  194  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  29.52 
 
 		 458 aa  193  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  31.59 
 
 		 458 aa  192  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3971  potassium transporter peripheral membrane component  29.52 
 
 		 458 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0755481  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  31.88 
 
 		 443 aa  192  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  29.52 
 
 		 458 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2872  potassium transporter peripheral membrane component  32.42 
 
 		 457 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  28.85 
 
 		 458 aa  190  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1491  potassium transporter peripheral membrane component  31.52 
 
 		 458 aa  190  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2242  potassium transporter peripheral membrane component  30.84 
 
 		 458 aa  189  5.999999999999999e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0521644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1569  potassium transporter peripheral membrane component  31.07 
 
 		 458 aa  189  8e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0202479  normal  0.0449671 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2841  potassium transporter peripheral membrane component  31.07 
 
 		 458 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340173  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1453  potassium transporter peripheral membrane component  31.07 
 
 		 458 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.687964  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  29.07 
 
 		 458 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  29.07 
 
 		 458 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  29.07 
 
 		 458 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  29.07 
 
 		 458 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  29.07 
 
 		 458 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  29.28 
 
 		 465 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2622  potassium transporter peripheral membrane component  30.39 
 
 		 458 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637696 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  31.08 
 
 		 459 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03140  potassium transporter peripheral membrane component  28.85 
 
 		 458 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.946548  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0424  TrkA-N domain protein  28.85 
 
 		 458 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03091  hypothetical protein  28.85 
 
 		 458 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3674  potassium transporter peripheral membrane component  28.85 
 
 		 458 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3772  potassium transporter peripheral membrane component  28.85 
 
 		 458 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3585  potassium transporter peripheral membrane component  28.85 
 
 		 458 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.931761  normal  0.13042 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4612  potassium transporter peripheral membrane component  28.85 
 
 		 458 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00524775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3483  potassium transporter peripheral membrane component  28.85 
 
 		 458 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0624843  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0424  potassium transporter peripheral membrane component  28.85 
 
 		 458 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000421391 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  29.61 
 
 		 457 aa  183  6e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3721  potassium transporter peripheral membrane component  28.63 
 
 		 458 aa  183  7e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455601  hitchhiker  0.00773793 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0014  TrkA domain-containing protein  28.92 
 
 		 457 aa  182  7e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0240987 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  29 
 
 		 445 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  30.57 
 
 		 445 aa  180  4e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  25.56 
 
 		 450 aa  180  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  28.85 
 
 		 458 aa  180  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  28.85 
 
 		 458 aa  179  7e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0040  potassium transporter peripheral membrane component  29.69 
 
 		 467 aa  179  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0018  potassium transporter peripheral membrane component  29.56 
 
 		 477 aa  177  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.265003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  30.22 
 
 		 448 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0699  TrkA-N domain protein  29.98 
 
 		 444 aa  177  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4544  potassium transporter peripheral membrane component  31.11 
 
 		 492 aa  176  8e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  30.26 
 
 		 445 aa  175  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0038  potassium transporter peripheral membrane component  29.67 
 
 		 458 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  28.18 
 
 		 450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  27.89 
 
 		 458 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  28.26 
 
 		 458 aa  174  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  28.7 
 
 		 458 aa  172  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0081  potassium transporter peripheral membrane component  28.35 
 
 		 458 aa  172  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5999  potassium transporter peripheral membrane component  28.96 
 
 		 485 aa  171  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135992 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4082  potassium transporter peripheral membrane component  29.89 
 
 		 467 aa  171  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_29  cation transport protein, Trk system  27.43 
 
 		 454 aa  170  4e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2079  TrkA-N domain protein  30.62 
 
 		 458 aa  169  9e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1093  potassium transporter peripheral membrane component  28.1 
 
 		 458 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1114  potassium transporter peripheral membrane component  28.29 
 
 		 458 aa  168  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1072  potassium transporter peripheral membrane component  28.29 
 
 		 458 aa  168  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2209  potassium transporter peripheral membrane component  28.04 
 
 		 458 aa  168  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  30.16 
 
 		 457 aa  168  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1615  potassium transporter peripheral membrane component  28.18 
 
 		 458 aa  168  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1041  TrkA domain-containing protein  27.75 
 
 		 452 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0029  potassium transporter peripheral membrane component  27.86 
 
 		 454 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0030  potassium transporter peripheral membrane component  26.36 
 
 		 454 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0087  potassium transporter peripheral membrane component  28.76 
 
 		 466 aa  165  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0040  potassium transporter peripheral membrane component  28.22 
 
 		 469 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.165147 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0035  potassium transporter peripheral membrane component  27.33 
 
 		 469 aa  163  7e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5096  TrkA-N domain protein  30.37 
 
 		 448 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0021  potassium transporter peripheral membrane component  28.22 
 
 		 469 aa  162  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881079  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1310  potassium transporter peripheral membrane component  26.71 
 
 		 444 aa  162  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0028  potassium transporter peripheral membrane component  28 
 
 		 469 aa  161  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0021  potassium transporter peripheral membrane component  28.67 
 
 		 469 aa  161  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1358  potassium transporter peripheral membrane component  29.12 
 
 		 458 aa  160  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0024  potassium transporter peripheral membrane component  28 
 
 		 469 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.738729  normal  0.0894147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>