34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1501 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1501  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  385  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000010842  normal  0.0102039 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1356  hypothetical protein  39.53 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0989  hypothetical protein  34.39 
 
 		 185 aa  110  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2181  hypothetical protein  29.79 
 
 		 197 aa  95.9  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.498275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1242  hypothetical protein  34.42 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1773  hypothetical protein  35.37 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3353  Methyltransferase type 12  30.99 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1941  hypothetical protein  31.37 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.86805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0627  hypothetical protein  29.49 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.717835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0053  methyltransferase type 12  32.21 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1971  hypothetical protein  30.77 
 
 		 219 aa  51.6  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1172  hypothetical protein  29.58 
 
 		 236 aa  48.9  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0051  methyltransferase type 12  30.87 
 
 		 265 aa  48.9  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.139499  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0266  hypothetical protein  27.64 
 
 		 249 aa  48.5  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0032  methyltransferase type 12  30.87 
 
 		 265 aa  48.1  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.101791 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1037  Methyltransferase type 12  25.44 
 
 		 253 aa  47.8  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1892  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.47 
 
 		 424 aa  44.7  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2318  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  27.64 
 
 		 359 aa  43.5  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.300919  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1055  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.36 
 
 		 413 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.910912  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2351  modification methylase, HemK family  32.5 
 
 		 288 aa  43.5  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00004074 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1840  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.53 
 
 		 345 aa  42.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670431 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1498  hypothetical protein  22.83 
 
 		 262 aa  42.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0160  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.33 
 
 		 293 aa  42.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0529  methyltransferase small  29.57 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48517  predicted protein  31.65 
 
 		 403 aa  43.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1487  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.46 
 
 		 406 aa  42.4  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1238  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.99 
 
 		 683 aa  42.4  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.306171  normal  0.747537 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  33.33 
 
 		 285 aa  42  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2258  hypothetical protein  26.36 
 
 		 287 aa  42  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2285  hypothetical protein  26.36 
 
 		 287 aa  42  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1910  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.11 
 
 		 420 aa  41.6  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1002  methyltransferase type 12  28.68 
 
 		 257 aa  41.2  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2871  flagellar motor protein  26.67 
 
 		 297 aa  41.2  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  27.27 
 
 		 284 aa  41.2  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>