40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0947 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0947  L-seryl-tRNA selenium transferase  100 
 
 		 354 aa  718    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0999  L-seryl-tRNA selenium transferase  91.53 
 
 		 354 aa  661    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1682  L-seryl-tRNA selenium transferase  94.07 
 
 		 354 aa  680    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1219  L-seryl-tRNA selenium transferase  69.89 
 
 		 357 aa  508  1e-143  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.587199  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1169  L-seryl-tRNA selenium transferase  64.27 
 
 		 354 aa  463  1e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.497392  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1320  Selenocysteine synthase (seryl-tRNASer selenium transferase)-like protein  26.32 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603065  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5094  L-seryl-tRNA(ser) selenium transferase  29.37 
 
 		 398 aa  50.1  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3477  L-seryl-tRNA selenium transferase  26.67 
 
 		 473 aa  47.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.213454  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1814  selenocysteine synthase  24.29 
 
 		 465 aa  47.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.071718 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3866  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  25.27 
 
 		 365 aa  47  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.559786  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0676  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  25.27 
 
 		 365 aa  47  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0042  selenocysteine synthase  27.03 
 
 		 462 aa  46.6  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3766  selenocysteine synthase  27.03 
 
 		 462 aa  46.6  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6666  L-seryl-tRNA selenium transferase  28.82 
 
 		 398 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184749  normal  0.0169225 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0301  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  25.85 
 
 		 466 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4521  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  34 
 
 		 472 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4115  selenocysteine synthase  26.35 
 
 		 462 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2477  selenocysteine synthase  33.33 
 
 		 448 aa  45.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11390  seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  33.66 
 
 		 508 aa  45.1  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.308467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5759  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  28.67 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.646746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2704  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  32.38 
 
 		 402 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2990  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  27.65 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.625674  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0536  selenocysteine synthase  34.94 
 
 		 475 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5527  selenocysteine synthase  34.78 
 
 		 468 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1740  selenocysteine synthase  24.43 
 
 		 475 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.820555  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5215  selenocysteine synthase  31.91 
 
 		 425 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4375  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  31.58 
 
 		 372 aa  43.5  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.417275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63540  selenocysteine synthase  33.7 
 
 		 468 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5303  selenocysteine synthase  31.91 
 
 		 425 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5595  selenocysteine synthase  31.91 
 
 		 425 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.116536 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2255  selenocysteine synthase  31 
 
 		 480 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1696  selenocysteine synthase  31 
 
 		 480 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1903  selenocysteine synthase  31 
 
 		 480 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0105  hypothetical protein  27.19 
 
 		 348 aa  42.7  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0575  selenocysteine synthase  31 
 
 		 480 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.81182  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0711  selenocysteine synthase  31 
 
 		 495 aa  42.7  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0726  selenocysteine synthase  31 
 
 		 480 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1678.1  selenocysteine synthase  31 
 
 		 480 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2085  selenocysteine synthase  28.35 
 
 		 462 aa  42.7  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3738  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  41.77 
 
 		 429 aa  42.7  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241783  normal  0.0172698 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>