45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0214 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0214  polysulphide reductase, NrfD  100 
 
 
397 aa  790    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0355  polysulphide reductase, NrfD  31.62 
 
 
393 aa  171  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121208  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3346  Polysulphide reductase NrfD  28.06 
 
 
402 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000267  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1511  Polysulphide reductase NrfD  30.75 
 
 
382 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2196  Polysulphide reductase NrfD  26.68 
 
 
414 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203832  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1709  polysulphide reductase, NrfD  26.1 
 
 
397 aa  72  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0260794  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0451  Polysulphide reductase NrfD  25.25 
 
 
445 aa  70.1  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1664  polysulphide reductase, NrfD  24.93 
 
 
425 aa  68.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  24.76 
 
 
408 aa  66.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  24.05 
 
 
393 aa  66.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  22.98 
 
 
391 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  24.63 
 
 
348 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1207  Polysulphide reductase NrfD  27.55 
 
 
305 aa  63.2  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  23.55 
 
 
413 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2596  Polysulphide reductase NrfD  26.56 
 
 
388 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0779  formate dehydrogenase, b-type cytochrome subunit, putative  24.34 
 
 
401 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0875  Polysulphide reductase NrfD  24.88 
 
 
402 aa  60.5  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.946275  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3666  Polysulphide reductase NrfD  23.98 
 
 
380 aa  59.7  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.396142  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1061  polysulphide reductase, NrfD  25.32 
 
 
401 aa  59.7  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.079733 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  23.01 
 
 
388 aa  59.7  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  26.13 
 
 
400 aa  59.7  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_112  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  23.88 
 
 
393 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  21.56 
 
 
408 aa  57.4  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3085  polysulphide reductase NrfD  24.11 
 
 
405 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.488046  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0651  hmc operon protein 3  25.54 
 
 
389 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.958991  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2252  polysulphide reductase NrfD  24.59 
 
 
402 aa  57  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.38952  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2602  polysulphide reductase, NrfD  23.51 
 
 
398 aa  56.6  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2407  polysulphide reductase, NrfD  26.56 
 
 
388 aa  56.6  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  26.07 
 
 
389 aa  55.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0102  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit, putative  23.83 
 
 
393 aa  54.3  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3042  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.93 
 
 
744 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  22.55 
 
 
411 aa  52.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1872  Polysulphide reductase NrfD  25.79 
 
 
403 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1957  Polysulphide reductase NrfD  25.34 
 
 
403 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0356047  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2006  polysulphide reductase, NrfD  25.79 
 
 
403 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  25.96 
 
 
406 aa  49.7  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0266  polysulphide reductase, NrfD  23.08 
 
 
393 aa  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  22.82 
 
 
384 aa  44.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4229  Polysulphide reductase NrfD  24.21 
 
 
386 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0570  Polysulphide reductase NrfD  21.52 
 
 
389 aa  44.3  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0170  Polysulphide reductase NrfD  23.66 
 
 
378 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  27.78 
 
 
472 aa  43.5  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2265  Polysulphide reductase NrfD  22.01 
 
 
403 aa  43.1  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1957  Polysulphide reductase NrfD  22.01 
 
 
403 aa  43.1  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  26.76 
 
 
456 aa  42.7  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>