24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1236 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1236  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  442  1e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.348841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2059  transcriptional regulator, ArsR family  48.8 
 
 		 206 aa  196  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1567  regulatory protein, ArsR  42.31 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1711  regulatory protein, ArsR  39.13 
 
 		 213 aa  154  9e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.851073 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2633  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 206 aa  135  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1852  transcriptional regulator, ArsR family  33.17 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.211312 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0909  ArsR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 228 aa  92.4  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000018626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1374  transcriptional regulator, MarR family  50.62 
 
 		 218 aa  89  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.650648  normal  0.319866 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0612  ArsR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0588  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3005  transcriptional regulator, MarR family  52.56 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00979308  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2977  transcriptional regulator, ArsR family  52.56 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381665  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1516  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 399 aa  48.1  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  32.79 
 
 		 105 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  29.67 
 
 		 129 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  33.87 
 
 		 105 aa  43.5  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 117 aa  42.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 121 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 134 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0682  transcriptional regulator, ArsR family  27.4 
 
 		 97 aa  42.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 107 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1464  transcriptional regulator, ArsR family  30.3 
 
 		 97 aa  42  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1143  ArsR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 129 aa  41.6  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000407779  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1937  ArsR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 107 aa  41.6  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>