81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0913 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0913  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  649    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1871  metal dependent phosphohydrolase  34.27 
 
 
317 aa  198  9e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1796  metal dependent phosphohydrolase  30.98 
 
 
315 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000175278  normal  0.229909 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0157  metal dependent phosphohydrolase  28.03 
 
 
348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1026  metal dependent phosphohydrolase  30.16 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2466  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  28.05 
 
 
328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0701415  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1091  metal dependent phosphohydrolase  26.83 
 
 
347 aa  109  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal  0.443941 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1665  metal dependent phosphohydrolase  28.3 
 
 
388 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2548  metal dependent phosphohydrolase  28.1 
 
 
386 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98451e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0049  metal dependent phosphohydrolase  28.71 
 
 
371 aa  100  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1025  metal dependent phosphohydrolase  30.14 
 
 
336 aa  99.8  6e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0691  metal dependent phosphohydrolase  29.37 
 
 
344 aa  98.6  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000585513  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1164  metal dependent phosphohydrolase  30.54 
 
 
320 aa  97.4  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0667  metal dependent phosphohydrolase  29.72 
 
 
336 aa  97.4  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0022  metal dependent phosphohydrolase  26.58 
 
 
361 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0126816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2929  metal dependent phosphohydrolase  27.18 
 
 
366 aa  96.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.220477  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0147  metal dependent phosphohydrolase  28.22 
 
 
344 aa  96.7  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0129  metal dependent phosphohydrolase  27.18 
 
 
343 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0904  HD-superfamily hydrolase  28.47 
 
 
322 aa  94.4  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1122  HD domain-containing protein  28.86 
 
 
375 aa  92.8  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0086  metal dependent phosphohydrolase  26.56 
 
 
361 aa  92  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2193  HD-superfamily hydrolase  30.96 
 
 
314 aa  91.3  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0440  metal dependent phosphohydrolase  28.22 
 
 
377 aa  91.3  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000386707  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1443  metal dependent phosphohydrolase  32.37 
 
 
228 aa  89  9e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.281894  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1988  metal dependent phosphohydrolase  29.39 
 
 
295 aa  88.6  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.489678  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0723  metal dependent phosphohydrolase  33.09 
 
 
228 aa  88.6  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2404  HD-superfamily hydrolase  27.49 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0036501  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0730  HD-superfamily hydrolase  26.86 
 
 
316 aa  88.2  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1232  metal dependent phosphohydrolase  33.09 
 
 
228 aa  87.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1773  HD domain-containing protein  26.97 
 
 
313 aa  87.4  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0235466  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1929  3'-5' exoribonuclease YhaM  28.17 
 
 
313 aa  86.3  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1895  3'-5' exoribonuclease YhaM  28.17 
 
 
313 aa  86.3  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.469436  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2675  metal dependent phosphohydrolase  26.54 
 
 
384 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.606537 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2339  metal dependent phosphohydrolase  26.89 
 
 
347 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0317  metal dependent phosphohydrolase  28.62 
 
 
333 aa  83.2  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1404  metal dependent phosphohydrolase  26.01 
 
 
343 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248325  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0933  metal dependent phosphohydrolase  34.23 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1448  HD-superfamily hydrolase  28.03 
 
 
325 aa  82.4  0.000000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000046208  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1645  metal dependent phosphohydrolase  29.51 
 
 
352 aa  82.4  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0636  3'-5' exoribonuclease YhaM  28.71 
 
 
324 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000053339  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0796  3'-5' exoribonuclease YhaM  27.96 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1766  HD-superfamily hydrolase  26.06 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00925857  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl244  cmp-binding factor-1  27.56 
 
 
326 aa  80.5  0.00000000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0927  3'-5' exoribonuclease YhaM  27.27 
 
 
314 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.475944  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1243  metal dependent phosphohydrolase  32.86 
 
 
228 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0947  3'-5' exoribonuclease YhaM  27.42 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0716307  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1052  3'-5' exoribonuclease YhaM  27.42 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299092  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0933  3'-5' exoribonuclease YhaM  27.42 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0143521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1087  3'-5' exoribonuclease YhaM  27.42 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6154099999999997e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1180  3'-5' exoribonuclease YhaM  27.42 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000316143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0920  3'-5' exoribonuclease YhaM  27.42 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0118856  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1111  3'-5' exoribonuclease YhaM  27.42 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1012  3'-5' exoribonuclease YhaM  27.42 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4294  metal dependent phosphohydrolase  26.55 
 
 
375 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298288  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4249  3'-5' exoribonuclease YhaM  27.42 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000074521 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1317  metal dependent phosphohydrolase  25.88 
 
 
534 aa  75.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1452  3'-5' exoribonuclease YhaM  25.94 
 
 
376 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5784  metal dependent phosphohydrolase  26.69 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.825544 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2639  metal dependent phosphohydrolase  26.69 
 
 
528 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130174  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2543  metal dependent phosphohydrolase  27.01 
 
 
531 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1378  3'-5' exoribonuclease YhaM  26.54 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.280441  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0027  3'-5' exoribonuclease YhaM  27.91 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.838244  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0027  HD domain-containing protein  27.91 
 
 
323 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2013  HD-superfamily hydrolase  26.72 
 
 
387 aa  72  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000276986  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2446  metal dependent phosphohydrolase  26.05 
 
 
534 aa  69.7  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0473  hypothetical protein  30.15 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5827  metal dependent phosphohydrolase  23.57 
 
 
295 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.163543  normal  0.236354 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0847  metal dependent phosphohydrolase  30.26 
 
 
354 aa  64.3  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.241634  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3087  metal dependent phosphohydrolase  26 
 
 
330 aa  63.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0158  metal dependent phosphohydrolase  25.8 
 
 
315 aa  63.2  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0450  metal dependent phosphohydrolase  25.34 
 
 
309 aa  62.8  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2850  metal dependent phosphohydrolase  29.28 
 
 
309 aa  59.3  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0222  metal dependent phosphohydrolase  27.43 
 
 
170 aa  46.6  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2021  metal dependent phosphohydrolase  31.4 
 
 
287 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000315761  decreased coverage  0.0000000241246 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2313  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0277696  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2132  metal dependent phosphohydrolase  28.3 
 
 
187 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2355  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 
291 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0025797  decreased coverage  0.0000215512 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1081  metal dependent phosphohydrolase  28.46 
 
 
504 aa  42.7  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.075195  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0067  hypothetical protein  25.81 
 
 
186 aa  42.7  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.250606  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3339  relaxase  35.14 
 
 
569 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3034  hypothetical protein  37.88 
 
 
575 aa  42.7  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.877854  normal  0.900283 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>