50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3034 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3339  relaxase  60.7 
 
 		 569 aa  668    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2962  relaxase  60.28 
 
 		 595 aa  651    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3034  hypothetical protein  100 
 
 		 575 aa  1179    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.877854  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0932  Relaxase  55.02 
 
 		 616 aa  615  1e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2405  hypothetical protein  55.05 
 
 		 612 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2175  relaxase  54.87 
 
 		 614 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0425  Relaxase  51.43 
 
 		 599 aa  607  9.999999999999999e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2872  Relaxase  54.08 
 
 		 615 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0649581  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1614  Relaxase  53.21 
 
 		 593 aa  597  1e-169  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1245  relaxase  53.58 
 
 		 627 aa  588  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0694  Relaxase  54.44 
 
 		 615 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1173  hypothetical protein  52.52 
 
 		 615 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4190  relaxase  51.71 
 
 		 617 aa  572  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136156  normal  0.342151 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2364  relaxase  52.03 
 
 		 680 aa  570  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000606357  hitchhiker  0.000030776 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3435  relaxase  52.33 
 
 		 621 aa  570  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428865 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1387  relaxase  52.84 
 
 		 660 aa  560  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0831  hypothetical protein  46.06 
 
 		 642 aa  552  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0568  relaxase  52.93 
 
 		 623 aa  552  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1422  hypothetical protein  46.98 
 
 		 634 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4433  relaxase  47.03 
 
 		 639 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60130  hypothetical protein  46.72 
 
 		 639 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829078  hitchhiker  0.00000000146114 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4529  relaxase  47.09 
 
 		 643 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36580  Relaxase-related protein  45.53 
 
 		 631 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1792  hypothetical protein  38.34 
 
 		 640 aa  426  1e-118  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0733  relaxase  56.62 
 
 		 318 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3950  relaxase  29.82 
 
 		 624 aa  248  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0583286  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4049  relaxase  25.69 
 
 		 560 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2772  metal dependent phosphohydrolase  29.95 
 
 		 861 aa  144  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4118  relaxase  25.67 
 
 		 569 aa  143  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3357  helicase/Zfx/Zfy transcription activation region domain-containing protein  24.56 
 
 		 551 aa  140  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3687  putative helicase  37.12 
 
 		 398 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2691  protein of unknown function DUF1528  50.41 
 
 		 282 aa  136  9e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0709  protein of unknown function DUF1528  32.2 
 
 		 485 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51640  hypothetical protein  47.5 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000358498  hitchhiker  0.000035713 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0400  relaxase  32.31 
 
 		 570 aa  109  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361957  normal  0.0772849 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4411  hypothetical protein  27.91 
 
 		 308 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25110  hypothetical protein  47.42 
 
 		 97 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3051  protein of unknown function DUF1528  33.33 
 
 		 478 aa  95.9  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0065  type IV conjugative transfer system protein TraI  26 
 
 		 990 aa  93.6  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2814  Relaxase  26.3 
 
 		 1096 aa  87.8  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.127016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4740  Relaxase  22.19 
 
 		 721 aa  74.7  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.428204 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5472  hypothetical protein  21.07 
 
 		 611 aa  64.7  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0952115 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1550  FHA domain-containing protein  24.43 
 
 		 597 aa  61.2  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.230045  normal  0.0300322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2597  relaxase  23.53 
 
 		 549 aa  58.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.856889 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2854  hypothetical protein  19.92 
 
 		 445 aa  57  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2994  hypothetical protein  20.76 
 
 		 445 aa  56.2  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2306  relaxase  22.35 
 
 		 571 aa  53.9  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.201735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4265  relaxase  30.13 
 
 		 941 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350547  normal  0.8702 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4267  relaxase  17.97 
 
 		 642 aa  45.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0904  HD-superfamily hydrolase  30.77 
 
 		 322 aa  44.3  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>