50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_36580 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0831  hypothetical protein  58.91 
 
 		 642 aa  745    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4529  relaxase  64.33 
 
 		 643 aa  769    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4433  relaxase  63.31 
 
 		 639 aa  760    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1422  hypothetical protein  58.37 
 
 		 634 aa  722    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36580  Relaxase-related protein  100 
 
 		 631 aa  1281    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60130  hypothetical protein  63.31 
 
 		 639 aa  762    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829078  hitchhiker  0.00000000146114 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2405  hypothetical protein  53.04 
 
 		 612 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2872  Relaxase  52.21 
 
 		 615 aa  610  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0649581  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1614  Relaxase  51.13 
 
 		 593 aa  607  9.999999999999999e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0932  Relaxase  52.23 
 
 		 616 aa  607  9.999999999999999e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0425  Relaxase  50.16 
 
 		 599 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2175  relaxase  52.88 
 
 		 614 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1245  relaxase  52.72 
 
 		 627 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1173  hypothetical protein  51.54 
 
 		 615 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0694  Relaxase  52.68 
 
 		 615 aa  593  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3435  relaxase  51.79 
 
 		 621 aa  590  1e-167  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428865 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4190  relaxase  52.56 
 
 		 617 aa  585  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136156  normal  0.342151 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2364  relaxase  53.16 
 
 		 680 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000606357  hitchhiker  0.000030776 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1387  relaxase  52.98 
 
 		 660 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0568  relaxase  51 
 
 		 623 aa  530  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3034  hypothetical protein  45.53 
 
 		 575 aa  525  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.877854  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3339  relaxase  46.93 
 
 		 569 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2962  relaxase  46.43 
 
 		 595 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1792  hypothetical protein  36.77 
 
 		 640 aa  434  1e-120  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0733  relaxase  67.56 
 
 		 318 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3950  relaxase  29.63 
 
 		 624 aa  242  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0583286  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51640  hypothetical protein  63.56 
 
 		 125 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000358498  hitchhiker  0.000035713 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2691  protein of unknown function DUF1528  53.08 
 
 		 282 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698088  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2772  metal dependent phosphohydrolase  29.3 
 
 		 861 aa  121  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4049  relaxase  33.97 
 
 		 560 aa  117  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0400  relaxase  35.71 
 
 		 570 aa  115  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361957  normal  0.0772849 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4118  relaxase  32.54 
 
 		 569 aa  113  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0709  protein of unknown function DUF1528  30.04 
 
 		 485 aa  107  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3687  putative helicase  31.58 
 
 		 398 aa  103  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25110  hypothetical protein  50 
 
 		 97 aa  100  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4411  hypothetical protein  27.43 
 
 		 308 aa  94.7  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0065  type IV conjugative transfer system protein TraI  27.31 
 
 		 990 aa  91.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3357  helicase/Zfx/Zfy transcription activation region domain-containing protein  27.04 
 
 		 551 aa  90.5  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3051  protein of unknown function DUF1528  31.75 
 
 		 478 aa  89  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2814  Relaxase  26.19 
 
 		 1096 aa  88.6  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.127016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4740  Relaxase  23.48 
 
 		 721 aa  80.1  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.428204 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4265  relaxase  27.86 
 
 		 941 aa  77  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350547  normal  0.8702 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5472  hypothetical protein  23.47 
 
 		 611 aa  64.7  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0952115 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2994  hypothetical protein  22.65 
 
 		 445 aa  55.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2854  hypothetical protein  21.79 
 
 		 445 aa  54.7  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2597  relaxase  22.22 
 
 		 549 aa  53.9  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.856889 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4267  relaxase  19.61 
 
 		 642 aa  53.5  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2306  relaxase  22.1 
 
 		 571 aa  52.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.201735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1550  FHA domain-containing protein  21.29 
 
 		 597 aa  49.7  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.230045  normal  0.0300322 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2850  metal dependent phosphohydrolase  40.3 
 
 		 309 aa  43.9  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>