38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_pSN254_0065 on replicon NC_009140
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009140  SNSL254_pSN254_0065  type IV conjugative transfer system protein TraI  100 
 
 		 990 aa  2013    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2814  Relaxase  38.08 
 
 		 1096 aa  264  6e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.127016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4740  Relaxase  32.09 
 
 		 721 aa  198  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.428204 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4267  relaxase  30.92 
 
 		 642 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1550  FHA domain-containing protein  30.81 
 
 		 597 aa  179  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.230045  normal  0.0300322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2306  relaxase  32.7 
 
 		 571 aa  178  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.201735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2597  relaxase  32.6 
 
 		 549 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.856889 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5472  hypothetical protein  29.85 
 
 		 611 aa  152  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0952115 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4265  relaxase  28.02 
 
 		 941 aa  144  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350547  normal  0.8702 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0425  Relaxase  26.93 
 
 		 599 aa  117  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3950  relaxase  26.91 
 
 		 624 aa  111  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0583286  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2175  relaxase  25.86 
 
 		 614 aa  109  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2405  hypothetical protein  27.16 
 
 		 612 aa  108  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0932  Relaxase  25.57 
 
 		 616 aa  107  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2872  Relaxase  24.94 
 
 		 615 aa  106  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0649581  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1422  hypothetical protein  27.94 
 
 		 634 aa  105  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114874  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0831  hypothetical protein  27.3 
 
 		 642 aa  102  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2772  metal dependent phosphohydrolase  28.98 
 
 		 861 aa  99.8  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1614  Relaxase  27.71 
 
 		 593 aa  98.2  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3339  relaxase  24.89 
 
 		 569 aa  97.8  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0568  relaxase  26.33 
 
 		 623 aa  94.7  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0694  Relaxase  24.19 
 
 		 615 aa  94.7  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2364  relaxase  26.13 
 
 		 680 aa  94.7  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000606357  hitchhiker  0.000030776 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1245  relaxase  26.75 
 
 		 627 aa  94.7  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0733  relaxase  28.06 
 
 		 318 aa  94.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1173  hypothetical protein  27.39 
 
 		 615 aa  94  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3034  hypothetical protein  26 
 
 		 575 aa  94  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.877854  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3435  relaxase  25.32 
 
 		 621 aa  93.2  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428865 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4190  relaxase  27.16 
 
 		 617 aa  93.2  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136156  normal  0.342151 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1792  hypothetical protein  30.2 
 
 		 640 aa  93.6  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4433  relaxase  24.57 
 
 		 639 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60130  hypothetical protein  24.57 
 
 		 639 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829078  hitchhiker  0.00000000146114 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4529  relaxase  25.7 
 
 		 643 aa  85.5  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2962  relaxase  25.67 
 
 		 595 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1387  relaxase  25.08 
 
 		 660 aa  81.3  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36580  Relaxase-related protein  27.31 
 
 		 631 aa  81.3  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5223  hypothetical protein  26.32 
 
 		 493 aa  80.1  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4329  hypothetical protein  26.09 
 
 		 408 aa  44.7  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>