43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2597 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2306  relaxase  76.88 
 
 		 571 aa  806    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.201735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2597  relaxase  100 
 
 		 549 aa  1104    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.856889 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1550  FHA domain-containing protein  55.05 
 
 		 597 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.230045  normal  0.0300322 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4740  Relaxase  33.69 
 
 		 721 aa  227  4e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.428204 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4267  relaxase  33.84 
 
 		 642 aa  204  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5472  hypothetical protein  32.55 
 
 		 611 aa  184  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0952115 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0065  type IV conjugative transfer system protein TraI  32.6 
 
 		 990 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2814  Relaxase  31.2 
 
 		 1096 aa  149  9e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.127016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5223  hypothetical protein  26.5 
 
 		 493 aa  92.4  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4265  relaxase  23.45 
 
 		 941 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350547  normal  0.8702 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1422  hypothetical protein  24.01 
 
 		 634 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2962  relaxase  23.39 
 
 		 595 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3339  relaxase  24.02 
 
 		 569 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3034  hypothetical protein  22.62 
 
 		 575 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.877854  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0831  hypothetical protein  23.42 
 
 		 642 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2872  Relaxase  24.08 
 
 		 615 aa  63.5  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0649581  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6503  hypothetical protein  27.81 
 
 		 452 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718541  normal  0.842994 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3950  relaxase  21.47 
 
 		 624 aa  60.1  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0583286  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0568  relaxase  24.85 
 
 		 623 aa  59.3  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0694  Relaxase  22.42 
 
 		 615 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3435  relaxase  25.53 
 
 		 621 aa  58.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428865 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5612  hypothetical protein  26.92 
 
 		 446 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2175  relaxase  22.55 
 
 		 614 aa  57  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2405  hypothetical protein  22.55 
 
 		 612 aa  56.6  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0932  Relaxase  22.22 
 
 		 616 aa  56.2  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4433  relaxase  21.22 
 
 		 639 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2364  relaxase  24.14 
 
 		 680 aa  54.3  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000606357  hitchhiker  0.000030776 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2772  metal dependent phosphohydrolase  26.56 
 
 		 861 aa  53.5  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3751  hypothetical protein  26.67 
 
 		 373 aa  52.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.417297 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1614  Relaxase  22.16 
 
 		 593 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4529  relaxase  20.87 
 
 		 643 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60130  hypothetical protein  21.11 
 
 		 639 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829078  hitchhiker  0.00000000146114 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0425  Relaxase  23.16 
 
 		 599 aa  50.8  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1792  hypothetical protein  21.45 
 
 		 640 aa  48.5  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1245  relaxase  24.66 
 
 		 627 aa  48.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36580  Relaxase-related protein  22.01 
 
 		 631 aa  48.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1173  hypothetical protein  23.67 
 
 		 615 aa  47.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4329  hypothetical protein  24.46 
 
 		 408 aa  47.4  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1519  hypothetical protein  28.41 
 
 		 420 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5184  type IV secretory pathway, putative conjugative relaxase  28.41 
 
 		 420 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4190  relaxase  24.83 
 
 		 617 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136156  normal  0.342151 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6308  hypothetical protein  31.51 
 
 		 413 aa  44.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0733  relaxase  23.24 
 
 		 318 aa  44.3  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>