48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3950 on replicon NC_008739
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008739  Maqu_3950  relaxase  100 
 
 		 624 aa  1287    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0583286  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3339  relaxase  30.9 
 
 		 569 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2962  relaxase  30.6 
 
 		 595 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3034  hypothetical protein  29.82 
 
 		 575 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.877854  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4529  relaxase  30 
 
 		 643 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4433  relaxase  29.31 
 
 		 639 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0932  Relaxase  30.38 
 
 		 616 aa  233  8.000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0831  hypothetical protein  28.46 
 
 		 642 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1245  relaxase  29.02 
 
 		 627 aa  232  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1614  Relaxase  29.05 
 
 		 593 aa  232  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2872  Relaxase  29.61 
 
 		 615 aa  232  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0649581  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60130  hypothetical protein  29.03 
 
 		 639 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829078  hitchhiker  0.00000000146114 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2405  hypothetical protein  29.78 
 
 		 612 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0425  Relaxase  28.97 
 
 		 599 aa  226  7e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36580  Relaxase-related protein  29.34 
 
 		 631 aa  225  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4190  relaxase  29.54 
 
 		 617 aa  224  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136156  normal  0.342151 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2175  relaxase  29.46 
 
 		 614 aa  223  7e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0694  Relaxase  27.8 
 
 		 615 aa  221  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1173  hypothetical protein  28.72 
 
 		 615 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2364  relaxase  29.95 
 
 		 680 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000606357  hitchhiker  0.000030776 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3435  relaxase  28.98 
 
 		 621 aa  209  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428865 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1792  hypothetical protein  26.79 
 
 		 640 aa  201  3e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0568  relaxase  26.75 
 
 		 623 aa  199  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1422  hypothetical protein  33.06 
 
 		 634 aa  196  9e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1387  relaxase  33.15 
 
 		 660 aa  171  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0733  relaxase  33.69 
 
 		 318 aa  140  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2772  metal dependent phosphohydrolase  27.13 
 
 		 861 aa  117  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2814  Relaxase  28.26 
 
 		 1096 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.127016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0065  type IV conjugative transfer system protein TraI  26.91 
 
 		 990 aa  112  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4118  relaxase  27.4 
 
 		 569 aa  81.3  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0400  relaxase  27.66 
 
 		 570 aa  77.8  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361957  normal  0.0772849 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0709  protein of unknown function DUF1528  26.32 
 
 		 485 aa  76.3  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4049  relaxase  26 
 
 		 560 aa  76.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3687  putative helicase  26.64 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3357  helicase/Zfx/Zfy transcription activation region domain-containing protein  25.12 
 
 		 551 aa  70.5  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4740  Relaxase  23.42 
 
 		 721 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.428204 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4411  hypothetical protein  25.08 
 
 		 308 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4265  relaxase  24.09 
 
 		 941 aa  64.3  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350547  normal  0.8702 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51640  hypothetical protein  35.58 
 
 		 125 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000358498  hitchhiker  0.000035713 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2597  relaxase  21.47 
 
 		 549 aa  60.8  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.856889 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2691  protein of unknown function DUF1528  32.11 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698088  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1550  FHA domain-containing protein  22.43 
 
 		 597 aa  56.2  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.230045  normal  0.0300322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2306  relaxase  21.24 
 
 		 571 aa  54.3  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.201735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3051  protein of unknown function DUF1528  24.79 
 
 		 478 aa  53.5  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4267  relaxase  26.62 
 
 		 642 aa  52.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2854  hypothetical protein  20.22 
 
 		 445 aa  52  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2994  hypothetical protein  20.22 
 
 		 445 aa  51.2  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5472  hypothetical protein  20.34 
 
 		 611 aa  47.4  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0952115 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>