33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4411 on replicon NC_009036
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009036  Sbal_4411  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1245  relaxase  29.54 
 
 		 627 aa  116  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2405  hypothetical protein  29.34 
 
 		 612 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0932  Relaxase  26.99 
 
 		 616 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2175  relaxase  28.53 
 
 		 614 aa  105  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3034  hypothetical protein  28.1 
 
 		 575 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.877854  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0694  Relaxase  28.75 
 
 		 615 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2872  Relaxase  28.66 
 
 		 615 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0649581  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4529  relaxase  27.53 
 
 		 643 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1173  hypothetical protein  28.17 
 
 		 615 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0425  Relaxase  26.07 
 
 		 599 aa  100  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2962  relaxase  26.9 
 
 		 595 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3339  relaxase  27.99 
 
 		 569 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4433  relaxase  27.3 
 
 		 639 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60130  hypothetical protein  27.09 
 
 		 639 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829078  hitchhiker  0.00000000146114 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1387  relaxase  25.86 
 
 		 660 aa  93.2  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36580  Relaxase-related protein  27.43 
 
 		 631 aa  92.8  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1614  Relaxase  25.3 
 
 		 593 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1422  hypothetical protein  25.84 
 
 		 634 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114874  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0831  hypothetical protein  26.38 
 
 		 642 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1792  hypothetical protein  28.33 
 
 		 640 aa  89  9e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3435  relaxase  27.06 
 
 		 621 aa  87  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428865 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0568  relaxase  25.62 
 
 		 623 aa  85.9  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3950  relaxase  25.08 
 
 		 624 aa  66.2  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0583286  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0400  relaxase  29.91 
 
 		 570 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361957  normal  0.0772849 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2364  relaxase  39.71 
 
 		 680 aa  60.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000606357  hitchhiker  0.000030776 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4118  relaxase  29.91 
 
 		 569 aa  60.5  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4049  relaxase  26.83 
 
 		 560 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4190  relaxase  36.76 
 
 		 617 aa  58.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136156  normal  0.342151 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2691  protein of unknown function DUF1528  27.27 
 
 		 282 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698088  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51640  hypothetical protein  27.64 
 
 		 125 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000358498  hitchhiker  0.000035713 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3357  helicase/Zfx/Zfy transcription activation region domain-containing protein  27.19 
 
 		 551 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3687  putative helicase  25.93 
 
 		 398 aa  43.1  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>