140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2691 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2691  protein of unknown function DUF1528  100 
 
 		 282 aa  580  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1614  Relaxase  80.95 
 
 		 593 aa  377  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0425  Relaxase  57.33 
 
 		 599 aa  266  4e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1245  relaxase  51.5 
 
 		 627 aa  228  9e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2364  relaxase  48.97 
 
 		 680 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000606357  hitchhiker  0.000030776 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3435  relaxase  56.02 
 
 		 621 aa  216  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428865 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1387  relaxase  50 
 
 		 660 aa  216  5e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4190  relaxase  55.17 
 
 		 617 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136156  normal  0.342151 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2405  hypothetical protein  55.29 
 
 		 612 aa  208  8e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0694  Relaxase  57 
 
 		 615 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1173  hypothetical protein  47.46 
 
 		 615 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2872  Relaxase  47.83 
 
 		 615 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0649581  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2175  relaxase  56.52 
 
 		 614 aa  203  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0932  Relaxase  55.98 
 
 		 616 aa  202  5e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0568  relaxase  64.44 
 
 		 623 aa  192  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0831  hypothetical protein  41.29 
 
 		 642 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25110  hypothetical protein  68.82 
 
 		 97 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1422  hypothetical protein  41.71 
 
 		 634 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36580  Relaxase-related protein  36.71 
 
 		 631 aa  149  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60130  hypothetical protein  39.47 
 
 		 639 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829078  hitchhiker  0.00000000146114 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4433  relaxase  39.56 
 
 		 639 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3034  hypothetical protein  42.16 
 
 		 575 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.877854  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4529  relaxase  41.98 
 
 		 643 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3339  relaxase  37.21 
 
 		 569 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51640  hypothetical protein  50.43 
 
 		 125 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000358498  hitchhiker  0.000035713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2962  relaxase  37.1 
 
 		 595 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1704  transposase IS3/IS911 family protein  80 
 
 		 96 aa  109  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1583  transposase IS3/IS911 family protein  80 
 
 		 96 aa  109  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0140  transposase IS3/IS911 family protein  80 
 
 		 96 aa  109  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2162  transposase IS3/IS911 family protein  78.46 
 
 		 96 aa  106  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.102712  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1374  transposase IS3/IS911 family protein  76.92 
 
 		 96 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2844  transposase IS3/IS911 family protein  91.84 
 
 		 66 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000226837  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1792  hypothetical protein  29.41 
 
 		 640 aa  76.3  0.0000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3950  relaxase  30 
 
 		 624 aa  59.3  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0583286  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4049  relaxase  29.63 
 
 		 560 aa  58.9  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4118  relaxase  31.82 
 
 		 569 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4411  hypothetical protein  27.27 
 
 		 308 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2772  metal dependent phosphohydrolase  27.16 
 
 		 861 aa  52  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3357  helicase/Zfx/Zfy transcription activation region domain-containing protein  27.69 
 
 		 551 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0400  relaxase  32.14 
 
 		 570 aa  50.1  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361957  normal  0.0772849 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2613  transposase IS3/IS911 family protein  37.1 
 
 		 77 aa  48.9  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1057  transposase IS3/IS911 family protein  41.51 
 
 		 135 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.905137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1090  transposase IS3/IS911 family protein  41.51 
 
 		 135 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1480  transposase IS3/IS911 family protein  41.51 
 
 		 135 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10456 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1364  transposase IS3/IS911 family protein  41.51 
 
 		 135 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.059427 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0674  hypothetical protein  27.86 
 
 		 410 aa  47.4  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.204696  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2538  transposase IS3/IS911 family protein  52.38 
 
 		 108 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1505  hypothetical cytosolic protein  27.86 
 
 		 410 aa  47.4  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.293741  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C60  transposase  45.24 
 
 		 357 aa  46.6  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0664  transposase  45.24 
 
 		 96 aa  46.6  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0849  transposase  45.24 
 
 		 96 aa  46.6  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00575778  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0855  transposase  45.24 
 
 		 96 aa  46.6  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000259877  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0883  transposase  45.24 
 
 		 96 aa  46.6  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.453287  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1037  transposase  45.24 
 
 		 96 aa  46.6  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000447764  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1086  transposase  45.24 
 
 		 96 aa  46.6  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1672  transposase  45.24 
 
 		 96 aa  46.6  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1412  transposase  45.24 
 
 		 96 aa  46.2  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000502951  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1916  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 108 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  43.75 
 
 		 97 aa  46.2  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2589  putative IS3 transposase, TnpA  30.77 
 
 		 142 aa  45.8  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.789608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2278  transposase IS3/IS911  43.48 
 
 		 96 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00280  transposase IS3/IS911 family protein  42 
 
 		 98 aa  45.8  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13730  transposase IS3/IS911 family protein  42 
 
 		 98 aa  45.8  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169245  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  43.14 
 
 		 90 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  43.14 
 
 		 90 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1485  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 94 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2200  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 94 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2950  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 94 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2694  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 94 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2010  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 94 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0063  IS66 family element, orf1  38.78 
 
 		 139 aa  45.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854269  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4274  ISSfl4 ORF1  42.31 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6484  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 		 108 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0377  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 		 108 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2571  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 		 108 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00789723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6051  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 		 108 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6111  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 		 108 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0567792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1828  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 94 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1073  IS3 family transposase orfA  34.69 
 
 		 93 aa  44.3  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.604189  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1115  IS3 family transposase orfA  34.69 
 
 		 93 aa  44.3  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1011  IS3 family transposase orfA  34.69 
 
 		 93 aa  44.3  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1014  IS3 family transposase orfA  34.69 
 
 		 93 aa  44.3  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0025  transposase family  39.58 
 
 		 139 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000603896  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0719  transposase orfA, IS3 family  48.78 
 
 		 106 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.854293 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0709  protein of unknown function DUF1528  24.6 
 
 		 485 aa  44.3  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1560  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 94 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  48.78 
 
 		 97 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1824  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 94 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3665  transposase IS3/IS911 family protein  42.55 
 
 		 96 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0598755  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1548  transposase  45.83 
 
 		 95 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0276  transposase IS3/IS911 family protein  32.05 
 
 		 126 aa  43.9  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1613  transposase IS3/IS911 family protein  47.83 
 
 		 92 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  47.83 
 
 		 92 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.908697  normal  0.454882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3805  transposase IS3/IS911 family protein  47.83 
 
 		 92 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5424  transposase IS3/IS911 family protein  47.83 
 
 		 92 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0257  putative transposase  45.45 
 
 		 145 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0626977 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  41.94 
 
 		 98 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  41.94 
 
 		 98 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2465  transposase IS3/IS911 family protein  39.13 
 
 		 78 aa  43.5  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  45.65 
 
 		 90 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>