51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2364 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0932  Relaxase  69.9 
 
 		 616 aa  821    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4190  relaxase  77.47 
 
 		 617 aa  906    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136156  normal  0.342151 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2872  Relaxase  68.69 
 
 		 615 aa  830    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0649581  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3435  relaxase  77.62 
 
 		 621 aa  904    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428865 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1614  Relaxase  68.68 
 
 		 593 aa  823    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2405  hypothetical protein  69.75 
 
 		 612 aa  830    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2175  relaxase  69.7 
 
 		 614 aa  821    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0425  Relaxase  65.65 
 
 		 599 aa  816    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1387  relaxase  78.89 
 
 		 660 aa  954    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1173  hypothetical protein  80.26 
 
 		 615 aa  957    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2364  relaxase  100 
 
 		 680 aa  1373    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000606357  hitchhiker  0.000030776 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1245  relaxase  80.1 
 
 		 627 aa  949    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0568  relaxase  61.44 
 
 		 623 aa  685    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0694  Relaxase  67.65 
 
 		 615 aa  811    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0831  hypothetical protein  51.09 
 
 		 642 aa  629  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1422  hypothetical protein  49.69 
 
 		 634 aa  611  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60130  hypothetical protein  51.33 
 
 		 639 aa  599  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829078  hitchhiker  0.00000000146114 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3034  hypothetical protein  52.51 
 
 		 575 aa  600  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.877854  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4433  relaxase  51.1 
 
 		 639 aa  598  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4529  relaxase  51.21 
 
 		 643 aa  589  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36580  Relaxase-related protein  53.48 
 
 		 631 aa  591  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3339  relaxase  50.65 
 
 		 569 aa  558  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2962  relaxase  51.85 
 
 		 595 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1792  hypothetical protein  36.48 
 
 		 640 aa  417  9.999999999999999e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0733  relaxase  59.15 
 
 		 318 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3950  relaxase  29.95 
 
 		 624 aa  230  6e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0583286  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2691  protein of unknown function DUF1528  48.58 
 
 		 282 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698088  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25110  hypothetical protein  70.53 
 
 		 97 aa  154  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2772  metal dependent phosphohydrolase  29.57 
 
 		 861 aa  148  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51640  hypothetical protein  50.82 
 
 		 125 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000358498  hitchhiker  0.000035713 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0709  protein of unknown function DUF1528  30.64 
 
 		 485 aa  114  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3687  putative helicase  33.89 
 
 		 398 aa  113  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4049  relaxase  35.14 
 
 		 560 aa  112  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0400  relaxase  34.17 
 
 		 570 aa  112  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361957  normal  0.0772849 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4118  relaxase  30.99 
 
 		 569 aa  111  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0065  type IV conjugative transfer system protein TraI  26.13 
 
 		 990 aa  105  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3357  helicase/Zfx/Zfy transcription activation region domain-containing protein  33.55 
 
 		 551 aa  102  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3051  protein of unknown function DUF1528  34.93 
 
 		 478 aa  94  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2814  Relaxase  28.53 
 
 		 1096 aa  94  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.127016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4411  hypothetical protein  25.37 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1550  FHA domain-containing protein  26.21 
 
 		 597 aa  69.7  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.230045  normal  0.0300322 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2994  hypothetical protein  24.12 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2854  hypothetical protein  23.35 
 
 		 445 aa  67  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4265  relaxase  23.26 
 
 		 941 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350547  normal  0.8702 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4267  relaxase  19.82 
 
 		 642 aa  58.5  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4740  Relaxase  19.5 
 
 		 721 aa  58.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.428204 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2597  relaxase  24.57 
 
 		 549 aa  58.2  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.856889 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2306  relaxase  24.06 
 
 		 571 aa  57.8  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.201735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5472  hypothetical protein  23.69 
 
 		 611 aa  57.4  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0952115 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0674  hypothetical protein  24.24 
 
 		 410 aa  44.7  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.204696  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1505  hypothetical cytosolic protein  24.24 
 
 		 410 aa  44.7  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.293741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>