27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_25110 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_25110  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  203  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4190  relaxase  78.49 
 
 		 617 aa  163  9e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136156  normal  0.342151 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1387  relaxase  76.04 
 
 		 660 aa  161  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2872  Relaxase  74.19 
 
 		 615 aa  159  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0649581  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3435  relaxase  74.74 
 
 		 621 aa  158  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428865 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1614  Relaxase  70.97 
 
 		 593 aa  155  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0694  Relaxase  74.19 
 
 		 615 aa  155  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1245  relaxase  72.63 
 
 		 627 aa  154  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2405  hypothetical protein  74.19 
 
 		 612 aa  153  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2364  relaxase  70.53 
 
 		 680 aa  153  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000606357  hitchhiker  0.000030776 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2175  relaxase  74.19 
 
 		 614 aa  152  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0568  relaxase  73.12 
 
 		 623 aa  152  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0932  Relaxase  73.12 
 
 		 616 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2691  protein of unknown function DUF1528  68.82 
 
 		 282 aa  150  8e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698088  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1173  hypothetical protein  68.42 
 
 		 615 aa  147  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0425  Relaxase  63.44 
 
 		 599 aa  140  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0831  hypothetical protein  56.52 
 
 		 642 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1422  hypothetical protein  54.35 
 
 		 634 aa  107  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51640  hypothetical protein  50 
 
 		 125 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000358498  hitchhiker  0.000035713 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4529  relaxase  50 
 
 		 643 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60130  hypothetical protein  50 
 
 		 639 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829078  hitchhiker  0.00000000146114 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4433  relaxase  48.91 
 
 		 639 aa  103  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3034  hypothetical protein  47.42 
 
 		 575 aa  102  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.877854  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36580  Relaxase-related protein  50 
 
 		 631 aa  99.8  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3339  relaxase  45.65 
 
 		 569 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2962  relaxase  44.09 
 
 		 595 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1792  hypothetical protein  32.65 
 
 		 640 aa  47.4  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>