12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6308 on replicon NC_007972
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007972  Rmet_6308  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  844    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1519  hypothetical protein  51.56 
 
 		 420 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5184  type IV secretory pathway, putative conjugative relaxase  51.56 
 
 		 420 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5612  hypothetical protein  41.26 
 
 		 446 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6503  hypothetical protein  40.49 
 
 		 452 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718541  normal  0.842994 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4740  Relaxase  29.63 
 
 		 721 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.428204 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1550  FHA domain-containing protein  32.53 
 
 		 597 aa  53.5  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.230045  normal  0.0300322 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2814  Relaxase  25.81 
 
 		 1096 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.127016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2306  relaxase  26.39 
 
 		 571 aa  47.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.201735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4329  hypothetical protein  25 
 
 		 408 aa  47.8  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4267  relaxase  28.04 
 
 		 642 aa  47  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2597  relaxase  31.51 
 
 		 549 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.856889 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>