13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5612 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5612  hypothetical protein  100 
 
 
446 aa  902    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6503  hypothetical protein  62.72 
 
 
452 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718541  normal  0.842994 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1519  hypothetical protein  44.14 
 
 
420 aa  351  2e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5184  type IV secretory pathway, putative conjugative relaxase  44.14 
 
 
420 aa  351  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6308  hypothetical protein  41.96 
 
 
413 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404497  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4740  Relaxase  34.83 
 
 
721 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.428204 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1550  FHA domain-containing protein  25.87 
 
 
597 aa  59.7  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.230045  normal  0.0300322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2597  relaxase  26.92 
 
 
549 aa  58.9  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.856889 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2306  relaxase  27.93 
 
 
571 aa  54.3  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.201735  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4267  relaxase  26 
 
 
642 aa  48.9  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2814  Relaxase  28.57 
 
 
1096 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.127016  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4329  hypothetical protein  21.95 
 
 
408 aa  44.3  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3751  hypothetical protein  24.14 
 
 
373 aa  43.5  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.417297 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>