15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6503 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6503  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  910    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718541  normal  0.842994 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5612  hypothetical protein  63.66 
 
 		 446 aa  533  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1519  hypothetical protein  43.45 
 
 		 420 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5184  type IV secretory pathway, putative conjugative relaxase  43.45 
 
 		 420 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6308  hypothetical protein  41.44 
 
 		 413 aa  302  9e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2597  relaxase  27.81 
 
 		 549 aa  62.4  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.856889 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2306  relaxase  27.81 
 
 		 571 aa  61.6  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.201735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4740  Relaxase  24.78 
 
 		 721 aa  61.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.428204 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1550  FHA domain-containing protein  25.17 
 
 		 597 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.230045  normal  0.0300322 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3751  hypothetical protein  24.12 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.417297 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1469  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.33 
 
 		 3689 aa  51.2  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2814  Relaxase  24.14 
 
 		 1096 aa  47  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.127016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4267  relaxase  23.3 
 
 		 642 aa  46.6  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5472  hypothetical protein  28.57 
 
 		 611 aa  44.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0952115 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4329  hypothetical protein  22.66 
 
 		 408 aa  44.3  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>