18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0672 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0672  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  619  1e-176  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0279  hypothetical protein  38.12 
 
 
361 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2731  hypothetical protein  41.01 
 
 
361 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2252  hypothetical protein  41.3 
 
 
362 aa  126  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.207907  normal  0.25741 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2219  exonuclease-like protein  34.81 
 
 
386 aa  94  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14620  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.45 
 
 
406 aa  77  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00393571  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0433  exonuclease-like protein  35.78 
 
 
423 aa  67.8  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1702  hypothetical protein  37.21 
 
 
290 aa  63.9  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1330  exonuclease-like protein  28.93 
 
 
392 aa  55.8  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000156681  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2376  hypothetical protein  35.54 
 
 
421 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3121  hypothetical protein  38.46 
 
 
414 aa  51.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1909  hypothetical protein  33.04 
 
 
421 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000148245  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0079  hypothetical protein  31.97 
 
 
340 aa  48.9  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.418653 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0923  exonuclease-like protein  35.8 
 
 
301 aa  48.1  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000308008  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1457  hypothetical protein  24.37 
 
 
251 aa  47.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1709  hypothetical protein  29.93 
 
 
164 aa  46.2  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000629582  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1783  hypothetical protein  28.7 
 
 
254 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.184707 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03332  hypothetical protein  31.03 
 
 
606 aa  44.3  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>