28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2715 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2715  YcfA-like  100 
 
 		 74 aa  149  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.307819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4379  YcfA family protein  62.5 
 
 		 74 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000396987  unclonable  0.0000000014534 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2943  YcfA family protein  39.71 
 
 		 74 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3153  YcfA family protein  39.71 
 
 		 74 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4650  YcfA family protein  39.13 
 
 		 75 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113321 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1350  YcfA family protein  39.13 
 
 		 75 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0250  YcfA-like  41.79 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4632  YcfA family protein  40.85 
 
 		 76 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0175  YcfA family protein  40.85 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4469  YcfA family protein  40.85 
 
 		 76 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0170  YcfA family protein  40.85 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58816  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1010  hypothetical protein  33.33 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000868639  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0870  hypothetical protein  37.68 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000000055222  normal  0.0369438 
 
 
 
NC_011884  Cyan7425_3185  YcfA family protein  38.03 
 
 		 73 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1494  hypothetical protein  35.21 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0656607  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1240  YcfA family protein  37.68 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2005  YcfA family protein  37.68 
 
 		 74 aa  44.7  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0386325  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0161  YcfA family protein  40.68 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0631  YcfA family protein  38.71 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0378293  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0377  YcfA-like  33.33 
 
 		 73 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0773151 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2354  hypothetical protein  34.78 
 
 		 74 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.104234  normal  0.0102619 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1246  YcfA family protein  33.33 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0669  YcfA-like  38.46 
 
 		 75 aa  42.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1100  YcfA family protein  44.29 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5956  YcfA family protein  36.92 
 
 		 74 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2364  hypothetical protein  34.78 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404097  normal  0.0567112 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3343  YcfA family protein  40.35 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429453  decreased coverage  0.00934326 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3102  YcfA-like  39.73 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0480568  normal  0.0893777 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>