29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1425 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1425  S-layer-like domain-containing protein  100 
 
 
414 aa  842    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137658  normal  0.104765 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2198  S-layer-like domain-containing protein  41.16 
 
 
425 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1655  S-layer-like domain-containing protein  36.67 
 
 
431 aa  258  1e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.19387  normal  0.999316 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0760  S-layer-like domain-containing protein  40.29 
 
 
427 aa  249  6e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0390726  normal  0.722575 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2655  hypothetical protein  28.96 
 
 
517 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0177957  normal  0.130435 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0984  hypothetical protein  29.55 
 
 
408 aa  105  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0894  hypothetical protein  24 
 
 
389 aa  103  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.263737  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1820  hypothetical protein  25.32 
 
 
430 aa  83.2  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.219836  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1253  hypothetical protein  25.36 
 
 
415 aa  67  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.290386 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0063  hypothetical protein  25.47 
 
 
380 aa  63.9  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.775578  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0263  hypothetical protein  26.13 
 
 
521 aa  63.2  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1648  hypothetical protein  25.07 
 
 
455 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.544844  hitchhiker  0.00111677 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2383  hypothetical protein  24.36 
 
 
405 aa  60.5  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00285086  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2930  hypothetical protein  23.75 
 
 
386 aa  59.3  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000188138  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0296  hypothetical protein  24.31 
 
 
520 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361629  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1670  hypothetical protein  24.31 
 
 
520 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0492  hypothetical protein  24.04 
 
 
379 aa  56.6  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.65383  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0573  hypothetical protein  25.87 
 
 
521 aa  56.6  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.687596  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1638  hypothetical protein  24.32 
 
 
521 aa  55.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0320  hypothetical protein  24.4 
 
 
459 aa  53.5  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.758746  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1296  hypothetical protein  29.37 
 
 
547 aa  53.9  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.229034  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0700  hypothetical protein  27.54 
 
 
411 aa  53.5  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0080  hypothetical protein  23.38 
 
 
415 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000000000412436  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1026  hypothetical protein  22.65 
 
 
422 aa  47.4  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.441563  normal  0.903414 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0110  hypothetical protein  21.61 
 
 
266 aa  46.6  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0683  hypothetical protein  25.81 
 
 
413 aa  46.6  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.383867  normal  0.499356 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0680  hypothetical protein  32.69 
 
 
418 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0769  S-layer-like domain-containing protein  24.75 
 
 
449 aa  44.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0629441  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3171  S-layer-like domain-containing protein  24.26 
 
 
815 aa  43.9  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.412777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>