28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1213 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1213  RDD  100 
 
 		 176 aa  361  3e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0799296  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2289  RDD domain-containing protein  43.79 
 
 		 202 aa  99  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  35.58 
 
 		 170 aa  88.2  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  31.93 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  37.5 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  31.01 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  32.9 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3591  hypothetical protein  29.11 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157612  normal  0.0949488 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  28.78 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1364  RDD domain-containing protein  31.85 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000121263  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  39.77 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2608  RDD domain-containing protein  33.06 
 
 		 456 aa  67.8  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.107491 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04050  RDD family protein  31.36 
 
 		 424 aa  66.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3457  RDD domain containing protein  31.82 
 
 		 205 aa  64.3  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.052067 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  42.67 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4968  YxaI  43.59 
 
 		 77 aa  62  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2609  serine/threonine protein kinase  31.41 
 
 		 415 aa  61.2  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  28.14 
 
 		 310 aa  57.8  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  28.24 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  27.74 
 
 		 231 aa  52.4  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1340  serine/threonine protein kinase  23.12 
 
 		 536 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975368 
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  27.16 
 
 		 166 aa  49.3  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  34.25 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  25.44 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  29.53 
 
 		 270 aa  45.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  29.49 
 
 		 257 aa  45.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  26.14 
 
 		 159 aa  41.6  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0115  hypothetical protein  42.59 
 
 		 157 aa  41.2  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.539233  hitchhiker  0.000011217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>