43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0383 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0383  hypothetical protein  100 
 
 
342 aa  714    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1140  hypothetical protein  45.02 
 
 
348 aa  305  7e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1110  hypothetical protein  44.14 
 
 
347 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.506924  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1116  hypothetical protein  38.62 
 
 
349 aa  246  4e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4421  hypothetical protein  27.91 
 
 
420 aa  122  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  0.170958 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0581  polysaccharide deacetylase  30.25 
 
 
470 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0766  hypothetical protein  27.45 
 
 
423 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.249559 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1371  hypothetical protein  31.35 
 
 
470 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1832  hypothetical protein  32.99 
 
 
280 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3424  hypothetical protein  27.84 
 
 
358 aa  109  9.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2497  hypothetical protein  28.46 
 
 
294 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1559  hypothetical protein  27.85 
 
 
478 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462896  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3172  hypothetical protein  27.69 
 
 
304 aa  98.2  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.296474 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1128  hypothetical protein  26.25 
 
 
495 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1599  hypothetical protein  25.53 
 
 
466 aa  90.5  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3968  hypothetical protein  25.97 
 
 
501 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0443888 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1737  hypothetical protein  28.39 
 
 
469 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0814  hypothetical protein  26.18 
 
 
485 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0883  hypothetical protein  25.16 
 
 
453 aa  76.3  0.0000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.985622 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  27.73 
 
 
264 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05615  hypothetical protein  20.4 
 
 
405 aa  52  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.776737  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  28.91 
 
 
288 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4391  polysaccharide deacetylase  27.85 
 
 
296 aa  50.8  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.424954 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  28.02 
 
 
299 aa  49.7  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  28.5 
 
 
289 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  28.5 
 
 
289 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  28.5 
 
 
289 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06518  polysaccharide deacetylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G05030)  31.01 
 
 
295 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  25.32 
 
 
296 aa  47.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0672  polysaccharide deacetylase family protein  28.48 
 
 
293 aa  47.8  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.193798  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 
291 aa  47.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  26.44 
 
 
295 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  26.44 
 
 
295 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  30.43 
 
 
293 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  26.44 
 
 
295 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2033  polysaccharide deacetylase  27.22 
 
 
300 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
293 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  30 
 
 
293 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1656  polysaccharide deacetylase  32.05 
 
 
299 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2331  polysaccharide deacetylase  27.5 
 
 
293 aa  44.3  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1104  polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 
298 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  29.94 
 
 
299 aa  43.9  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  24.07 
 
 
315 aa  43.1  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>