21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0548 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0548  amine dehydrogenase  100 
 
 
400 aa  834    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0316966  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0565  methylamine dehydrogenase heavy chain  48.87 
 
 
410 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4730  methylamine dehydrogenase heavy chain  49.27 
 
 
417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0932481  normal  0.201487 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4080  amine dehydrogenase  27.51 
 
 
401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.655857  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2335  Amine dehydrogenase  29.45 
 
 
409 aa  142  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0035  Amine dehydrogenase  28.25 
 
 
408 aa  135  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.137586  normal  0.0109788 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3254  amine dehydrogenase  28.53 
 
 
385 aa  129  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000080765  decreased coverage  0.00024338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2224  amine dehydrogenase  26.88 
 
 
383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0557  amine dehydrogenase  28.24 
 
 
386 aa  127  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5062  amine dehydrogenase  29.09 
 
 
385 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3305  amine dehydrogenase  29.09 
 
 
385 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5222  amine dehydrogenase  29.31 
 
 
385 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4997  amine dehydrogenase  27.95 
 
 
385 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3809  amine dehydrogenase  28.35 
 
 
385 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.623781 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4472  amine dehydrogenase  27.78 
 
 
385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3818  methylamine dehydrogenase heavy subunit  27.07 
 
 
405 aa  120  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.55568  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1685  amine dehydrogenase  27.99 
 
 
391 aa  119  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.664981  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0160  amine dehydrogenase  27.2 
 
 
383 aa  117  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3580  amine dehydrogenase  26.09 
 
 
385 aa  117  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643394  normal  0.58903 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0601  amine dehydrogenase  25.82 
 
 
385 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4363  methylamine dehydrogenase heavy subunit  25.93 
 
 
387 aa  116  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382707  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>