29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3052 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3052  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  508  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.542554 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3276  hypothetical protein  99.25 
 
 		 265 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3250  hypothetical protein  92.86 
 
 		 265 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0818  hypothetical protein  62.95 
 
 		 286 aa  240  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0307205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4717  hypothetical protein  57.25 
 
 		 295 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0194174  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4202  hypothetical protein  57.83 
 
 		 310 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0193396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4418  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  40.46 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3782  hypothetical protein  42.37 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1688  hypothetical protein  42.48 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.086166 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1511  hypothetical protein  39.25 
 
 		 255 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1388  hypothetical protein  38.01 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881994  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5505  hypothetical protein  36.95 
 
 		 256 aa  135  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1126  hypothetical protein  38.27 
 
 		 267 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.577564  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2566  hypothetical protein  45.71 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348776 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2838  hypothetical protein  35.34 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1436  hypothetical protein  34.9 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2072  hypothetical protein  28.66 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3427  hypothetical protein  28.95 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0467043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2706  hypothetical protein  28.32 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1394  hypothetical protein  29.73 
 
 		 325 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1942  FlaA locus 229 kDa protein  26.77 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0697  hypothetical protein  29.73 
 
 		 439 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.261572  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0415  hypothetical protein  29.17 
 
 		 169 aa  50.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3261  hypothetical protein  31.3 
 
 		 201 aa  46.2  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2950  hypothetical protein  27.48 
 
 		 205 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.283763 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1315  hypothetical protein  37.29 
 
 		 185 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215271  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2975  hypothetical protein  37.29 
 
 		 185 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.701427 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0574  hypothetical protein  28.89 
 
 		 176 aa  43.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1331  hypothetical protein  26.61 
 
 		 229 aa  42  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0746592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>