60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2349 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2349  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2628  protein of unknown function DUF423  97.56 
 
 		 123 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.382663  normal  0.0718783 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2306  protein of unknown function DUF423  88.62 
 
 		 123 aa  147  7e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.454103  normal  0.0930723 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3501  hypothetical protein  65.04 
 
 		 127 aa  123  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610166 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5379  protein of unknown function DUF423  63.41 
 
 		 123 aa  93.6  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5083  hypothetical protein  67.95 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225516  normal  0.744804 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0815  hypothetical protein  50 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.837156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7328  hypothetical protein  45.9 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0071  hypothetical protein  50 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00440778 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3072  hypothetical protein  39.5 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.628352  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3445  hypothetical protein  42.37 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104865  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2649  hypothetical protein  48.81 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.831092  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3362  hypothetical protein  44.55 
 
 		 132 aa  62  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.389012 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0634  protein of unknown function DUF423  47.15 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0629  hypothetical protein  46.67 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3298  protein of unknown function DUF423  51.46 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00419882 
 
 
-
 
NC_004310  BR0634  hypothetical protein  46.67 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.156601  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3701  hypothetical protein  41.53 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2331  hypothetical protein  36.67 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1480  hypothetical protein  47.97 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3505  hypothetical protein  36.11 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.248867  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4468  hypothetical protein  28.46 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2662  hypothetical protein  31.48 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0681  hypothetical protein  50 
 
 		 122 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1612  membrane protein DUF423  33.33 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.221104  normal  0.524793 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0152  hypothetical protein  39.76 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.318848  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0331  protein of unknown function DUF423  39.76 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.120447 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2762  hypothetical protein  33.04 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.340098  normal  0.38705 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3902  hypothetical protein  30.4 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0328  protein of unknown function DUF423  34.74 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.858167  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3913  hypothetical protein  30.83 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2781  hypothetical protein  31.71 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.650934  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2982  hypothetical protein  33.91 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3262  protein of unknown function DUF423  47.17 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.319272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2013  protein of unknown function DUF423  36.94 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3469  hypothetical protein  35.09 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0108117  hitchhiker  0.000383928 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3376  hypothetical protein  32.28 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.432758  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2499  hypothetical protein  35 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.300029  decreased coverage  0.000130725 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0928  hypothetical protein  32.28 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00438881  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2993  hypothetical protein  31.15 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5521  hypothetical protein  29.17 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5436  hypothetical protein  30 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5515  hypothetical protein  30 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3320  hypothetical protein  33.91 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00120689  normal  0.931239 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4169  hypothetical protein  35.59 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.338071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1603  hypothetical protein  38.14 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5090  hypothetical protein  29.17 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000494012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5571  hypothetical protein  29.17 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5073  hypothetical protein  29.17 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000730403  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3011  protein of unknown function DUF423  50 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2079  hypothetical protein  33.72 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5487  hypothetical protein  29.17 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2261  protein of unknown function DUF423  34.82 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.328273  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3413  hypothetical protein  33.06 
 
 		 126 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3177  hypothetical protein  34.19 
 
 		 128 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.652307  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5243  hypothetical protein  28.33 
 
 		 122 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5642  hypothetical protein  28.33 
 
 		 122 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5185  hypothetical protein  29.17 
 
 		 122 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0692  membrane protein  30.33 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.874009  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3804  hypothetical protein  32.79 
 
 		 131 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00311639  unclonable  0.0000000190492 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>